piRNA可作為結(jié)直腸癌疾病進程的致癌調(diào)節(jié)因子和可能的預(yù)后標(biāo)志物[1]
結(jié)直腸癌是世界范圍內(nèi)第三大常見的癌癥,是第四大致死癌癥。由于結(jié)直腸的高風(fēng)險性和致死性,研究有效的防治方法是極其必要的。
目前,越來越多的證據(jù)顯示piRNA可能是人類癌癥中基因表達的重要表觀調(diào)節(jié)因子,不過piRNA在結(jié)直腸癌中的功能作用以及臨床意義還不清楚。因此作者對結(jié)直腸癌組織和配對正常組織(n=4)進行了smallRNA-Seq,篩選到4個顯著差異表達的piRNA(piR-23619,piR-24000,piR-1245和piR-26525)。在大量結(jié)直腸癌和正常對照中進行RT-PCR驗證發(fā)現(xiàn)piR-1245和piR-26525是顯著差異表達的。同時,通過TCGA數(shù)據(jù)庫查找發(fā)現(xiàn)piR-1245在多種癌癥中都是顯著差異表達的,且與結(jié)直腸癌的癌癥分級、轉(zhuǎn)移以及患者預(yù)后顯著相關(guān)。在結(jié)直腸癌細(xì)胞系HCT-116和SW480中敲除piR-1245,抑制細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡。作者通過在結(jié)直腸癌細(xì)胞系HCT-116中干擾piR-1245,基因芯片檢測mRNA表達變化來研究piR-1245對結(jié)直腸癌的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)受piR-1245影響的下游基因參與細(xì)胞生存相關(guān)通路。靶基因預(yù)測及表達分析發(fā)現(xiàn),piR-1245與直接作用的靶基因(ATF3, BTG1, DUSP1, FAS,NFKBIA, UPP1, SESN2, TP53INP1和MDX1)表達顯著負(fù)相關(guān)。所以piR-1245可作為結(jié)直腸癌疾病進程的致癌因子和可能的預(yù)后標(biāo)志物。
研究路線:
實驗結(jié)果:
圖1 結(jié)直腸癌中癌癥相關(guān)piRNA的臨床意義
圖2 在TCGA數(shù)據(jù)庫中,目標(biāo)piR-1245在其他多種癌癥中表達顯著上調(diào)。
圖3 piR-1245在結(jié)直腸癌細(xì)胞系HCT-116和SW480中促進克隆形成、細(xì)胞生長、遷移和侵襲,抑制細(xì)胞凋亡
圖4 鑒定piR-1245下游靶基因
圖5 piR-1245及其下游靶基因在結(jié)直腸癌中的表達相關(guān)性
1. Weng, W., et al., Novel evidence for a PIWI-interacting RNA (piRNA) as an oncogenic mediator of disease progression, and a potential prognostic biomarker in colorectal cancer. Mol Cancer, 2018. 17(1): p. 16.