手把手教你使用TCGA下載轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)

1.打開瀏覽器搜索“TCGA GDC”

2.鼠標(biāo)放置在 “Repository”處就會(huì)看到出現(xiàn)“browse and download data”字樣，說明轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)是在這里下載的

3.進(jìn)入“Repository”后先看右上角“Cart”處是否為“0”，不為零的話要先清除之前下載的數(shù)據(jù)，清除方法是選擇“Cart”，然后點(diǎn)擊右下角的“Remove From Cart”。

4.“Cart”里面的內(nèi)容清除之后，返回“Repository”，開始選擇需要下載的樣品信息“Cases”和需要下載的文件“Files”。

5.這里我們以乳腺癌為例，下載轉(zhuǎn)錄組信息，首先選擇樣品信息“Cases”，我們這里選擇的乳腺癌的所有信息，如果需要下載針對(duì)性的臨床信息可以在下拉框中自行選擇

6.然后選擇需要下載的文件“Files”，這里也可以再下拉框中根據(jù)自己需要的格式進(jìn)行下載

7.然后將文件添加到“Cart”, 即點(diǎn)擊“Add All Files to Cart”

8.總共篩選出1222個(gè)乳腺癌轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的樣本信息，進(jìn)入“Cart”頁(yè)面，選擇要下載的格式進(jìn)行下載

這樣我們的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息就下載完成了，小伙伴們?nèi)绻胍獙W(xué)習(xí)其他數(shù)據(jù)庫(kù)的使用，請(qǐng)持續(xù)關(guān)注呦！