手把手教你使用TCGA下載臨床數(shù)據(jù)

如何下載臨床數(shù)據(jù)？相信這個(gè)問題一定困擾過做科研的你，下面跟小編一起來Get這個(gè)技能吧！

1. 打開瀏覽器搜索“TCGA GDC”

2. 鼠標(biāo)放置在 “Repository”處就會(huì)看到出現(xiàn)“browse and download data”字樣，說明轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)是在這里下載的 

3. 進(jìn)入“Repository”后先看右上角“Cart”處是否為“0”，不為零的話要先清除之前下載的數(shù)據(jù)，清除方法是選擇“Cart”，然后點(diǎn)擊右下角的“Remove From Cart”。

4. “Cart”里面的內(nèi)容清除之后，點(diǎn)擊“Repository”，開始選擇需要下載的樣品信息“Cases”和需要下載的文件“Files”。

5. 這里我們以結(jié)腸癌COAD和直腸癌READ為例，下載臨床信息，首先選擇樣品信息“Cases”，我們這里選擇的結(jié)腸癌COAD和直腸癌READ的所有信息，如果需要下載針對性的臨床信息（這里我們選擇結(jié)腸癌COAD和直腸癌READ的數(shù)據(jù)進(jìn)行下載）可以在下拉框中自行選擇

6. 然后選擇需要下載的文件“Files”，這里也可以再下拉框中根據(jù)自己需要的格式進(jìn)行下載

7. 然后將文件添加到“Cart”, 即點(diǎn)擊“Add All Files to Cart”

8. 總共篩選出548個(gè)結(jié)腸癌和直腸癌臨床數(shù)據(jù)的樣本信息，進(jìn)入“Cart”頁面，選擇要下載的格式進(jìn)行下載

這樣我們的臨床數(shù)據(jù)的樣本信息就下載完成了，小伙伴們?nèi)绻胍獙W(xué)習(xí)其他數(shù)據(jù)庫的使用，請持續(xù)關(guān)注呦！