活細胞釋放的細胞外囊泡 (EV) 包括外泌體和微泡 (MV),它們包含來自親本細胞的各種分子,是疾病診斷和治療生物標志物的潛在來源。 miRNA 是 EV 中研究最充分的分子類型。EVmiRNA數(shù)據(jù)庫收集 EV 中全面的 miRNA 表達譜(17 種組織/疾病的 EVs 的 462 個 smRNA 測序數(shù)據(jù)集)。 在 EVmiRNA 數(shù)據(jù)庫中,不僅可以查詢miRNA 表達譜,還可以查詢包括miRNA 調節(jié)通路、miRNA 功能、miRNA 相關藥物以及生物標志物在內的相關信息。
http://bioinfo.life.hust.edu.cn/EVmiRNA/#!/
l 快速查詢
在數(shù)據(jù)庫主頁可以通過miRNA ID或者樣本類型進行快速查詢。
l Sample
數(shù)據(jù)庫收集了15種樣本來源的外泌體miRNA數(shù)據(jù)和6種樣本來源的微泡miRNA數(shù)據(jù),用戶可以點擊相應樣本進行查詢。結果也包括miRNA表達heatmap圖、每個miRNA在該樣本以及其他樣本中的表達情況、數(shù)據(jù)來源、參考文獻以及外泌體提取方法。
l miRNA
該模塊包括該數(shù)據(jù)庫收集的所有miRNA,用戶可以根據(jù)miRNA ID進行搜索。點擊“Detail”可以查看miRNA來源及不同癌癥類型中的表達情況。
l Specific miRNA
該模塊可查詢在某樣本中特異性表達的miRNA。
l Search
該模塊可進行2中查詢:1.根據(jù)miRNA ID查詢特定miRNA的信息;2.根據(jù)樣本類型、EV類型查詢特定樣本中所有miRNA。