EVmiRNA: 胞外囊泡miRNA數(shù)據(jù)庫

活細胞釋放的細胞外囊泡 (EV) 包括外泌體和微泡 (MV)，它們包含來自親本細胞的各種分子，是疾病診斷和治療生物標志物的潛在來源。 miRNA 是 EV 中研究最充分的分子類型。EVmiRNA數(shù)據(jù)庫收集 EV 中全面的 miRNA 表達譜（17 種組織/疾病的 EVs 的 462 個 smRNA 測序數(shù)據(jù)集）。 在 EVmiRNA 數(shù)據(jù)庫中，不僅可以查詢miRNA 表達譜，還可以查詢包括miRNA 調(diào)節(jié)通路、miRNA 功能、miRNA 相關(guān)藥物以及生物標志物在內(nèi)的相關(guān)信息。

http://bioinfo.life.hust.edu.cn/EVmiRNA/#!/

l  快速查詢

在數(shù)據(jù)庫主頁可以通過miRNA ID或者樣本類型進行快速查詢。

l  Sample

數(shù)據(jù)庫收集了15種樣本來源的外泌體miRNA數(shù)據(jù)和6種樣本來源的微泡miRNA數(shù)據(jù)，用戶可以點擊相應(yīng)樣本進行查詢。結(jié)果也包括miRNA表達heatmap圖、每個miRNA在該樣本以及其他樣本中的表達情況、數(shù)據(jù)來源、參考文獻以及外泌體提取方法。

l  miRNA

該模塊包括該數(shù)據(jù)庫收集的所有miRNA，用戶可以根據(jù)miRNA ID進行搜索。點擊“Detail”可以查看miRNA來源及不同癌癥類型中的表達情況。

l  Specific miRNA

該模塊可查詢在某樣本中特異性表達的miRNA。

l  Search

該模塊可進行2中查詢：1.根據(jù)miRNA ID查詢特定miRNA的信息；2.根據(jù)樣本類型、EV類型查詢特定樣本中所有miRNA。