NCAPD3是凝聚蛋白II復(fù)合物的三個(gè)非SMC亞基之一,在有絲分裂過程中對染色體的凝聚和分離起著重要作用。值得注意的是,在許多體細(xì)胞癌癥中發(fā)現(xiàn)NCAPD3水平升高。然而,NCAPD3在癌癥尤其是結(jié)直腸癌中的臨床作用、生物學(xué)功能和潛在的分子機(jī)制仍不清楚。目前,有研究發(fā)現(xiàn)NCAPD3在結(jié)直腸癌發(fā)生和結(jié)直腸癌進(jìn)展中促進(jìn)糖代謝重編程并增強(qiáng)Warburg效應(yīng),該文章發(fā)表在《JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH》,IF: 11.161。
技術(shù)路線:
主要研究結(jié)果:
1. NCAPD3在CRC細(xì)胞和臨床標(biāo)本中過表達(dá)
對人類CRC組織及其對應(yīng)的正常組織進(jìn)行RNA-seq分析,數(shù)據(jù)分析顯示,與正常組織相比,腫瘤組織中NCAPD3的表達(dá)明顯升高(圖1A)。與正常組織相比,NCAPD3在腫瘤組織中顯著過表達(dá)(圖1B, C)。此外,Western blot檢測顯示,與人類正常結(jié)腸黏膜細(xì)胞系FHC相比,CRC細(xì)胞系中NCAPD3的蛋白水平顯著增加(圖1D上圖)。在臨床標(biāo)本中,通過qRTPCR、Western blot和免疫化學(xué)分析,CRC組織中NCAPD3 mRNA和蛋白水平也明顯高于正常組織(圖1D下圖,1E, 1F)。這些結(jié)果表明,NCAPD3在CRC中過表達(dá),提示NCAPD3與CRC關(guān)系密切。
圖1 NCAPD3在人CRC中表達(dá)較高
2. NCAPD3增強(qiáng)CRC細(xì)胞的糖代謝重編程
在之前的一項(xiàng)研究中,從HT-29(結(jié)腸上皮腺癌細(xì)胞)中免疫沉淀NCAPD3,并用液相色譜-質(zhì)譜分析共沉淀蛋白。通過KOBAS在線平臺對文中發(fā)表的假定的NCAPD3相互作用體進(jìn)行了功能富集分析,揭示了NCAPD3相互作用體在糖酵解和TCA循環(huán)中發(fā)揮作用(圖2A)。與陰性對照相比,HCT116細(xì)胞中NCAPD3過表達(dá)顯著增加了丙酮酸/乳酸/ATP的產(chǎn)生水平、乳酸脫氫酶的活性和2-NBDG的攝取,但降低了丙酮酸脫氫酶的活性,而在NCAPD3敲低的SW480細(xì)胞中,這一結(jié)果顯著逆轉(zhuǎn)(圖2B-G)。此外,NCAPD3過表達(dá)可上調(diào)GLUT1、HK2、ENO1、PKM2和LDHA蛋白水平,但不上調(diào)PGK1和PGAM1蛋白水平。相比之下,NCAPD3敲除PGK1和PGAM1外,降低了這些糖酵解基因的表達(dá)(圖2H)。如圖2I所示,NCAPD3敲低顯著降低了PDK1、PDK3和p-PDHE1α的表達(dá)水平,在NCAPD3過表達(dá)的細(xì)胞中得到了相反的結(jié)果,而PDHE1α的總蛋白水平保持不變。這些結(jié)果表明,NCAPD3增強(qiáng)了CRC細(xì)胞的有氧糖酵解,并減少了葡萄糖衍生碳到TCA循環(huán)的通量。
圖2 NCAPD3增強(qiáng)CRC細(xì)胞的糖代謝重編程
3. NCAPD3通過調(diào)控CRC細(xì)胞中的c-Myc及其下游代謝相關(guān)基因促進(jìn)有氧糖酵解
為了確定c-Myc參與了NCAPD3調(diào)控的有氧糖酵解,首先分析了臨床標(biāo)本的RNA-Seq數(shù)據(jù)。通過分析,發(fā)現(xiàn)CRC組織中的轉(zhuǎn)錄因子c-Myc水平明顯高于正常結(jié)直腸組織(圖3A)。如圖3B所示,過表達(dá)NCAPD3的HCT116細(xì)胞中c-Myc的蛋白和mRNA水平顯著升高,而敲低NCAPD3的SW480細(xì)胞中這一變化逆轉(zhuǎn)。為了驗(yàn)證c-Myc對NCAPD3的糖酵解促進(jìn)作用是必要的,在NCAPD3穩(wěn)定過表達(dá)的HCT116細(xì)胞中使用siRNA和c-Myc抑制劑。數(shù)據(jù)顯示,c-Myc敲低和10058-F4 (c-Myc抑制劑)處理可逆轉(zhuǎn)NCAPD3誘導(dǎo)的GLUT1、HK2、ENO1、PKM2和LDHA的高表達(dá) (圖3C)。丙酮酸、乳酸釋放和ATP產(chǎn)生分析的結(jié)果加強(qiáng)了這一結(jié)果(圖3D-F),這表明沉默或抑制c-Myc可以廢除NCAPD3在糖酵解調(diào)節(jié)中的功能。
此外,進(jìn)行了免疫沉淀和western-blot分析,以探索NCAPD3和c-Myc在細(xì)胞核中的潛在相互作用。從數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)anti-NCAPD3抗體可以在HCT116細(xì)胞中共沉淀c-Myc。此外,在NCAPD3敲低的SW480細(xì)胞中,二者的相互作用也得到了支持(圖3G, H)。染色質(zhì)免疫沉淀(ChIP)-PCR檢測進(jìn)一步證實(shí),HCT116細(xì)胞中過表達(dá)NCAPD3后,GLUT1、HK2、ENO1、PKM2和LDHA基因啟動(dòng)子處c-Myc的結(jié)合富集顯著增加,而在NCAPD3敲低的SW480細(xì)胞中得到的結(jié)果相反(圖3I, J)。
這些結(jié)果表明c-Myc參與了CRC細(xì)胞中NCAPD3的糖酵解促進(jìn)作用。NCAPD3通過增加糖酵解基因GLUT1、HK2、ENO1、PKM2和LDHA的啟動(dòng)子中c-Myc的表達(dá)和招募更多的c-Myc來促進(jìn)Warburg效應(yīng)。
圖3 NCAPD3上調(diào)c-Myc并促進(jìn)其下游代謝基因的表達(dá)
4. NCAPD3通過E2F1介導(dǎo)的丙酮酸脫氫酶抑制減弱CRC細(xì)胞中TCA循環(huán)通量
如圖4A和B所示,NCAPD3過表達(dá)上調(diào)E2F1及其靶基因PDK1和PDK3的水平,進(jìn)而導(dǎo)致p-PDHE1α(但總PDHE1α)的增加和PDH活性的抑制,而用siRNA或抑制劑或抑制E2F1則逆轉(zhuǎn)了NCAPD3過表達(dá)誘導(dǎo)的結(jié)果。此外,免疫沉淀實(shí)驗(yàn)顯示,抗NCAPD3抗體可以在HCT116細(xì)胞或NCAPD3敲除的SW480細(xì)胞中共沉淀E2F1(圖4C, D),這表明NCAPD3和E2F1在CRC細(xì)胞中相互作用。在HCT116細(xì)胞中,抗E2F1抗體不能共沉淀c-Myc,反之亦然,這表明NCAPD3、c-Myc和E2F1不能形成三聚體復(fù)合物(圖4E)。在HCT116細(xì)胞中,NCAPD3過表達(dá)增加了E2F1與PDK1和PDK3基因啟動(dòng)子的結(jié)合富集,而在NCAPD3敲低SW480細(xì)胞中得到了相反的結(jié)果(圖4F, G)。
圖4 NCAPD3通過調(diào)節(jié)葡萄糖代謝切換器E2F1抑制TCA循環(huán)通量
5. NCAPD3具有促進(jìn)CRC細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移的作用
NCAPD3過表達(dá)促進(jìn)了HCT116細(xì)胞的增殖和克隆形成(圖5A, B)。此外,劃傷愈合實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,與對照相比,NCAPD3異位表達(dá)顯著增加了HCT116細(xì)胞的遷移(圖5C)。在NCAPD3-敲低的SW480細(xì)胞中,細(xì)胞的增殖、集落形成和遷移都被大大削弱(圖5A-C)。此外,NCAPD3可以通過siRNA敲低(圖5D-F)來增強(qiáng)細(xì)胞增殖、集散形成和遷移。組織學(xué)分析顯示,與對照組相比,接受HCT116-NCAPD3亞群的小鼠形成了肺轉(zhuǎn)移灶(圖5G)。與對照組相比,過表達(dá)NCAPD3導(dǎo)致肺轉(zhuǎn)移瘤中Ki67染色更強(qiáng)(圖5H)。這些結(jié)果表明,c-Myc和E2F1參與了NCAPD3在體外促進(jìn)CRC細(xì)胞增殖和遷移。此外,體內(nèi)數(shù)據(jù)還表明,HCT116細(xì)胞中過表達(dá)NCAPD3可促進(jìn)腫瘤肺轉(zhuǎn)移。
圖5 NCAPD3促進(jìn)CRC細(xì)胞增殖、遷移和腫瘤轉(zhuǎn)移
6. NCAPD3通過增強(qiáng)CRC細(xì)胞有氧糖酵解在小鼠皮下移植瘤模型中促進(jìn)腫瘤生長
過表達(dá)NCAPD3組中移植瘤的大小和重量較對照組明顯增大(圖6A, B),而2-DG組過表達(dá)NCAPD3組移植瘤的大小和重量較過表達(dá)NCAPD3組明顯減小(圖6A,B)。與對照細(xì)胞相比,HCT116-NCAPD3細(xì)胞形成的異種移植瘤的乳酸水平明顯升高,而2-DG處理后的HCT116-NCAPD3細(xì)胞形成的腫瘤的乳酸水平較僅HCT116-NCAPD3細(xì)胞形成的腫瘤降低(圖6C)。NCAPD3過表達(dá)對移植瘤中糖酵解相關(guān)蛋白水平的影響與乳酸釋放實(shí)驗(yàn)得出的結(jié)論一致(圖6D)。
圖 6 NCAPD3 增強(qiáng)異種移植腫瘤小鼠模型中的腫瘤生長和有氧糖酵解
與野生型(WT)小鼠相比,NCAPD3小鼠在三次DSS處理中體重下降較少,實(shí)驗(yàn)結(jié)束時(shí)體重增加,結(jié)腸長度變長(圖7A、B),表明NCAPD3缺陷小鼠對DSS誘導(dǎo)的結(jié)腸炎的易感性低于野生型小鼠。此外,NCAPD3小鼠的腫瘤數(shù)量和腫瘤大小均顯著低于WT同窩小鼠(圖7C)。Western blotting數(shù)據(jù)證實(shí),敲除NCAPD3導(dǎo)致c-Myc、E2F1及其下游靶基因在蛋白水平顯著下調(diào),而PDHE1α蛋白總表達(dá)量不變(圖7D)。組織學(xué)上,與NCAPD3±小鼠相比,WT小鼠呈現(xiàn)上皮完整性缺失和幾乎完全的隱窩缺失(圖7E)。此外,IHC分析還顯示,敲除NCAPD3導(dǎo)致c-Myc、E2F1和GLUT1的染色明顯減弱(圖7E),同樣NCAPD3±小鼠的結(jié)直腸腫瘤增殖率顯著降低,Ki-67細(xì)胞核染色比例較低(圖7E)。這些體內(nèi)結(jié)果表明,NCAPD3缺乏可通過抑制糖代謝重編程和糖酵解來減輕AOM/DSS誘導(dǎo)的小鼠模型中結(jié)直腸腫瘤的發(fā)生。
圖7敲除NCAPD3可降低AOM/ DSS誘導(dǎo)的小鼠結(jié)直腸癌發(fā)生
8. CRC患者NCAPD3及其與代謝相關(guān)基因的相關(guān)性的臨床意義
NCAPD3分別與CRC組織中的c-Myc、ENO1、LDHA、E2F1、PDK1和PDK3呈強(qiáng)正相關(guān),這進(jìn)一步支持了我們的體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)結(jié)果(圖8A)。如圖8B-D所示,NCAPD3-High/ PKM2-High、NCAPD3-High/LDHA-High和NCAPD3-High/ PDK1-High患者的總生存期較短。最后,使用Western blot方法評估了6對臨床CRC組織及其相應(yīng)的相鄰正常組織中NCAPD3、c-Myc和E2F1的表達(dá)水平。與相鄰正常組織相比,CRC組織中NCAPD3、c-Myc和E2F1的表達(dá)量較高(圖8E)。這些結(jié)果表明NCAPD3及其誘導(dǎo)Warburg效應(yīng)可能在結(jié)直腸腫瘤的發(fā)生和結(jié)直腸癌的發(fā)展過程中發(fā)揮重要作用,可能是結(jié)直腸癌的潛在標(biāo)記物和臨床治療靶點(diǎn)。
圖8 CRC患者NCAPD3的臨床意義及其與代謝相關(guān)基因的相關(guān)性
結(jié)論:
在體內(nèi)和體外,NCAPD3通過增加c-Myc和E2F1的表達(dá)并將這兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子招募到其靶基因的啟動(dòng)子中,從而通過增強(qiáng)糖酵解過程和抑制TCA循環(huán)來重編碼糖代謝,提示NCAPD3在CRC的發(fā)生發(fā)展中調(diào)節(jié)糖代謝起著重要作用。