ncFO：鐵死亡相關的非編碼RNA數(shù)據(jù)庫

ncFO數(shù)據(jù)庫記錄了參與調節(jié)鐵死亡的實驗驗證和預測的非編碼RNA（ncRNAs）。ncFO總共記錄了90個實驗驗證條目和3260個預測條目。同時，ncFO數(shù)據(jù)庫還可以進行在線共表達分析、生存分析和差異表達分析。http://www.jianglab.cn/ncFO/

l   Search

用戶可以通過鐵死亡基因和三種 ncRNA（miRNA、lncRNA、circRNA）搜索所有經過實驗驗證的條目。

以鐵死亡相關基因“ACSL4”為例，點擊“Search”跳轉至結果頁面。搜索結果展示與ACSL4相關的ncRNA。

點擊“Correlation analysis”可以查看不同疾病中ACSL4與ncRNA的相關性。

l   Prediction tools

1.用戶可以通過鐵死亡基因、lncRNAs或miRNAs進行搜索，獲得調控鐵死亡基因的miRNAs/lncRNAs。

以“has-let-7b-5p”為例，搜索結果包含基本信息、分析工具、調控網絡及其詳細信息。

“Analysis tool”可以進行不同疾病中has-let-7b-5p的差異表達分析、生存分析、分期分析。

2. 用戶可以使用共表達分析預測與鐵死亡相關的ncRNA。用戶可以輸入鐵死亡基因、ncRNA 類型、cuttoff、分析方法并指定癌癥類型。共表達分析使用TCGA 數(shù)據(jù)集。

以“GPX4”與miRNA在乳腺癌中的共表達分析為例，結果中展示了miRNA與GPX4的相關性，miRNA在乳腺癌中的差異表達、分期、生存分析結果。