CircSC：?jiǎn)渭?xì)胞測(cè)序circRNA表達(dá)譜

CircSC使用由171項(xiàng)公共研究中的254590個(gè)細(xì)胞組成的全長(zhǎng)單細(xì)胞RNA測(cè)序數(shù)據(jù)集，以生成人類和小鼠細(xì)胞中circRNA的綜合表達(dá)譜。CircSC在這些scRNA-seq文庫(kù)中總共識(shí)別了196491個(gè)人類和310969個(gè)小鼠的circRNAs，揭示了腦樣本、發(fā)育中的胚胎和乳腺腫瘤中circRNAs的細(xì)胞類型特異性表達(dá)模式。

http://159.226.67.237/zhao/Database/circSC/index.html

l  Browse

用戶可以獲得每個(gè)研究的詳細(xì)信息，其中包括count矩陣、circRNA列表和實(shí)驗(yàn)元數(shù)據(jù)。

點(diǎn)擊“Study”跳轉(zhuǎn)至詳情頁(yè)查看、下載相關(guān)信息。對(duì)于有足夠細(xì)胞進(jìn)行細(xì)胞聚類分析的研究，提供每個(gè)細(xì)胞簇的標(biāo)記基因，并根據(jù)原始研究中提供的元數(shù)據(jù)注釋細(xì)胞類型。對(duì)于少于100個(gè)細(xì)胞的研究，只提供了circRNA列表。

l  Search

用戶可以通過組織、細(xì)胞類型、GEO ID和基因組坐標(biāo)、circRNA ID進(jìn)行搜索。

點(diǎn)擊“circRNA ID”可跳轉(zhuǎn)至circAtlas 2.0數(shù)據(jù)庫(kù)查看circRNA相關(guān)信息：