ScRNA-seq+免疫:前列腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移相關(guān)的免疫抑制

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2024-10-24
PCa LNM中腔細(xì)胞、免疫和間質(zhì)細(xì)胞的顯著異質(zhì)性可能不僅直接促使腫瘤進(jìn)展,還間接導(dǎo)致TME免疫抑制,這可能是PCa轉(zhuǎn)移的原因......

 

         轉(zhuǎn)移是導(dǎo)致前列腺癌(PCa)患者死亡的疾病進(jìn)展的關(guān)鍵。本文旨在通過使用單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq)分析PCa中腫瘤微環(huán)境(TME)的異質(zhì)性來探討淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(LNM)的機(jī)制。從四個(gè)PCa組織樣本中獲得32,766個(gè)細(xì)胞進(jìn)行scRNA-seq,結(jié)果顯示,在LNM中只有EEF2+FOLH1+腔亞群存在,并且它們出現(xiàn)在腔細(xì)胞分化的初期階段,這通過驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)證實(shí)。MYC通路在EEF2+FOLH1+腔亞群中富集,MYCPCa LNM相關(guān)。此外,MYC不僅促進(jìn)PCa的進(jìn)展,還通過調(diào)節(jié)PDL1CD47導(dǎo)致TME的免疫抑制。在LNM中,TMECD8+T細(xì)胞的比例以及NK細(xì)胞和單核細(xì)胞中的比例較原發(fā)病灶中較低,而ThTreg細(xì)胞相反。此外,TME中的這些免疫細(xì)胞經(jīng)歷了轉(zhuǎn)錄重編程,包括CCR7+IL7R+CD8+T亞群,以及表達(dá)腫瘤相關(guān)基因的M2樣單核細(xì)胞亞群,如CCR7SGKIRPL31。此外,與腫瘤進(jìn)展、腫瘤代謝和免疫抑制密切相關(guān)的STEAP4+、ADGRF5+CXCR4+、SRGNC+纖維母細(xì)胞亞群表明它們在PCa轉(zhuǎn)移中的貢獻(xiàn)。同時(shí),通過多色免疫熒光證實(shí)了PCa中存在CXCR4+纖維母細(xì)胞??傊?,PCa LNM中腔細(xì)胞、免疫和間質(zhì)細(xì)胞的顯著異質(zhì)性可能不僅直接促使腫瘤進(jìn)展,還間接導(dǎo)致TME免疫抑制,這可能是PCa轉(zhuǎn)移的原因,其中MYC發(fā)揮了作用。本文于20235月發(fā)表在《Experimental Hematology & OncologyIF10.9期刊上。

技術(shù)路線

主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果:

1、原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的TME細(xì)胞組成

         對(duì)兩名患有PCa的患者的四個(gè)腫瘤樣本進(jìn)行scRNA-seq分析,以確定它們的細(xì)胞組成(圖1A)。共獲得32,766個(gè)細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組,其中16,717個(gè)細(xì)胞來自原發(fā)病灶,16,049個(gè)細(xì)胞來自淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。UMAP分析基于細(xì)胞的基因型和典型標(biāo)記基因,鑒定了14個(gè)主要細(xì)胞類群(圖1BD),包括:(1)具有GZMK、CD8AIFNG高表達(dá)的CD8+T細(xì)胞;(2)特異性表達(dá)KRT18EPCAM的腔細(xì)胞;(3)具有ACTA2TAGLN高表達(dá)的纖維母細(xì)胞;(4)具有GZMB、NKG7GNLY高表達(dá)的NK細(xì)胞;以及(5)特異性表達(dá)HLA-DRA、C1QAC1QB的單核細(xì)胞,以及其他細(xì)胞類型的標(biāo)記基因(圖1D)。結(jié)果顯示了每個(gè)細(xì)胞類型中前10個(gè)高表達(dá)基因的表達(dá)譜,以及每個(gè)細(xì)胞類型的細(xì)胞比例(圖1CE)。值得注意的是,每個(gè)原發(fā)病灶樣本中都存在所有細(xì)胞類型,而在轉(zhuǎn)移病灶中基底細(xì)胞和中性粒細(xì)胞幾乎不存在(圖1C)。TME細(xì)胞組成的顯著差異暗示著原發(fā)病灶和淋巴轉(zhuǎn)移之間明顯的異質(zhì)性。


1 通過scRNA-seq鑒定出PCa中的14種細(xì)胞類型

 

2、腔細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄異質(zhì)性和InferCNV

         根據(jù)先前的研究,腔細(xì)胞和基底細(xì)胞是前列腺癌可能的起始細(xì)胞。對(duì)腔細(xì)胞的UMAP分析確定了總共七個(gè)亞群(圖2A),并展示了不同腔細(xì)胞亞群的基因表達(dá)模式(圖2B)。還展示了每個(gè)腔細(xì)胞亞群中前五個(gè)標(biāo)記基因,分別是EEF1A2、HBB、IGKC、NPYFOLH1在腔上1中高表達(dá)。在腔上5HBBIGKC高表達(dá),而NPYFOLH1在腔上7中高表達(dá)(圖2C)。GSVA顯示MYC和氧化磷酸化信號(hào)通路在腔上1亞群中富集,而TNF-α信號(hào)通路活性在腔上3亞群中增強(qiáng)。此外,腔上4亞群具有高的蛋白分泌和雄激素應(yīng)答信號(hào)通路富集得分,而E2FG2M信號(hào)通路在腔上6亞群中富集。腔上7亞群展示了在血管生成信號(hào)通路中的增強(qiáng)活性(圖2D)。

         InferCNV算法被用于識(shí)別染色體CNAs,以進(jìn)一步驗(yàn)證七個(gè)腔上亞群中是否存在惡性細(xì)胞。根據(jù)先前的研究,該方法可以識(shí)別典型的PCa基因改變,包括染色體8q增益和染色體8p、1316q缺失。此外,先前的DNA測序研究揭示0-50%PCa基因組具有CNAs,并且CNAs也是PCa的預(yù)后因素。而且,在大多數(shù)PCa病例中,次克隆CNAs的負(fù)擔(dān)遠(yuǎn)遠(yuǎn)超過克隆負(fù)擔(dān)。本文的InferCNV結(jié)果顯示在圖2E中。腔上亞群15以及37中的所有細(xì)胞都被聚集在一起。其他亞群中的所有細(xì)胞都被單獨(dú)分組(圖2E)。在CNAs的熱圖中,紅色和藍(lán)色分別表示片段染色體中基因表達(dá)值過高和過低。這意味著紅色顏色越深,染色體擴(kuò)增的程度越高,而藍(lán)色顏色越深,染色體喪失的程度越高。因此,研究結(jié)果顯示腔上亞群15以及37中的染色體CNAs的程度遠(yuǎn)高于其他簇。因此,腔上亞群15以及37中的細(xì)胞可能是惡性細(xì)胞(圖2E)。此外,腔上亞群15僅出現(xiàn)在轉(zhuǎn)移病灶中,暗示這兩個(gè)亞群可能在惡性細(xì)胞中包含有轉(zhuǎn)移能力的細(xì)胞(圖2G)。

         進(jìn)一步分析了原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移之間的差異表達(dá)基因(DEGs)及其功能富集,以揭示PCa淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的特定基因表達(dá)模式(圖2H-I)。結(jié)果顯示主要富集的功能性DEG途徑與免疫相關(guān),如白細(xì)胞和淋巴細(xì)胞活性的調(diào)控以及B細(xì)胞活性(圖2I),表明腫瘤免疫可能對(duì)PCa的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移產(chǎn)生影響。此外,還分析了腔細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子在原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移之間的差異(圖2FJ)。JDP2、IRF1、ENO1、HOXB2、IRF8、NELFEESRRA、SP8、KLF9、SF1、TFAP2AIRF7、CREB3GTF2F1、MXI1、CREB5、EGR3FOXO3、NFATC3CREM在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中都被激活,而在原發(fā)病灶中沒有激活(圖2FJ)。特別是NELFE在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的表達(dá)顯著高于原發(fā)病灶。有報(bào)道稱NELFE在許多癌癥中能促進(jìn)侵襲和轉(zhuǎn)移。因此,上述結(jié)果表明這些轉(zhuǎn)錄因子可能參與了PCa的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移(圖2J)。


2 腔室細(xì)胞的異質(zhì)性和CNV分析

 

隨后,選擇在EEF2+FOLH1+腔上亞群中具有特異性的標(biāo)記基因EEF1A2CCL5進(jìn)行免疫組化染色在PCa組織芯片上,結(jié)果在正常組織中顯示陰性結(jié)果。在原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的一些前列腺癌細(xì)胞呈現(xiàn)陽性表達(dá),這表明在PCa中存在這兩個(gè)亞群的細(xì)胞(圖3A)。免疫熒光顯示MEEF1A2CCL5LNCap細(xì)胞中均有表達(dá)(圖3B)。在LNCap細(xì)胞中下調(diào)MEEF1A2CCL5的表達(dá)可以顯著降低細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移的能力(圖3C-F)。

 

3 PCa中存在EEF2+FOLH1+腔上亞群細(xì)胞。

 

3、MYC可能通過促進(jìn)腫瘤細(xì)胞進(jìn)展和免疫抑制來促使淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移

腔上亞群15出現(xiàn)在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中。MYC通路在這些細(xì)胞中也顯示富集,因此進(jìn)行進(jìn)一步的調(diào)查。芯片IHC結(jié)果顯示MYC在細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中表達(dá),并且在PCa組織中的表達(dá)顯著強(qiáng)于正常前列腺組織。重要的是,淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中的MYC表達(dá)顯著高于原發(fā)病灶(圖4A),表明MYCPCa轉(zhuǎn)移有關(guān)。免疫熒光結(jié)果顯示,LNCap細(xì)胞中MYC、PDL1CD47均有表達(dá),而PDL1CD47主要表達(dá)在細(xì)胞質(zhì)中(圖4B)。從NCBIJASPAR數(shù)據(jù)庫獲取的結(jié)果顯示,PDL1CD47的啟動(dòng)子區(qū)域有MYC的結(jié)合位點(diǎn),證明PDL1CD47MYC的靶基因(圖4C)。通過敲低LNCap細(xì)胞中MYC的表達(dá)后,發(fā)現(xiàn)PDL1CD47mRNA和蛋白水平顯著下調(diào)(圖4D-F)。此外,Transwell結(jié)果表明MYC表達(dá)下調(diào)顯著降低了LNCap細(xì)胞的轉(zhuǎn)移能力(圖4G-H)。

 

4 MYC通過CD47PD-L1驅(qū)動(dòng)腫瘤進(jìn)展

 

4、腔細(xì)胞軌跡分析

細(xì)胞軌跡結(jié)果顯示在圖4中,其中Monocle 2將所有腔細(xì)胞分為七個(gè)狀態(tài)(圖5B)。圖4A顯示了根據(jù)Seurat進(jìn)行的降維聚類后,細(xì)胞根據(jù)其簇的分化軌跡。簇04分布在圖的右側(cè),而簇26分布在圖的左側(cè)。另外的三個(gè)簇(1、35)位于圖中部的下方(圖5A)。此外,腔細(xì)胞的分化軌跡以第二分支點(diǎn)為重要的轉(zhuǎn)折點(diǎn),從圖的右側(cè)到左側(cè)和下部(圖5C)。因此,腔細(xì)胞的總體分化發(fā)生在簇0、14到簇236之間。InferCNV結(jié)果顯示簇0、2、46是潛在的惡性細(xì)胞,而簇1、35是非惡性細(xì)胞。兩個(gè)簇04是轉(zhuǎn)移細(xì)胞,暗示具有轉(zhuǎn)移能力的癌細(xì)胞早期發(fā)生(圖5C)。此外,惡性細(xì)胞的分化方向與非惡性細(xì)胞不同。

接下來,探索了腔細(xì)胞分化過程中的轉(zhuǎn)錄組變化。選擇具有不同表達(dá)特征的代表性基因,觀察它們在細(xì)胞分化過程中的動(dòng)態(tài)變化(圖5C)。MYC相關(guān)的鋅指蛋白(MAZ)在一些重要基因,包括MYC、RASCT-1中發(fā)揮轉(zhuǎn)錄調(diào)控作用。MAZ的表達(dá)在細(xì)胞分化時(shí)間內(nèi)首先增加,然后急劇下降(圖5D)。唾液酸蛋白(SPN),也稱為LSNCD43,是一種跨膜唾液酸糖蛋白。隨著腔細(xì)胞的分化,SPN基因表達(dá)在基線處最初保持不變,然后急劇增加,稍有下降,最終迅速增加(圖5D)。圖5E顯示了在腔細(xì)胞分化過程中特征基因表達(dá)變化的可視化和聚類結(jié)果。隨后,根據(jù)分化過程,將腔細(xì)胞分為命運(yùn)1、分支前和命運(yùn)2子集。在腔細(xì)胞從命運(yùn)1到命運(yùn)2的分化過程中,所有變化的基因可以根據(jù)它們的表達(dá)水平分為四類(圖5F)。


5腔內(nèi)細(xì)胞的軌跡分析

 

5、原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶中CD8+ T細(xì)胞的異質(zhì)性特征

         在本研究中,鑒定了5,843個(gè)CD8+ T細(xì)胞(原發(fā)病灶中的3,069個(gè),轉(zhuǎn)移病灶中的2,774個(gè))。通過CD8+ T細(xì)胞的UMAP分析鑒定了四個(gè)亞群(圖6A)。此外,結(jié)果顯示在轉(zhuǎn)移病灶中,亞群03的比例顯著高于原發(fā)病灶(圖6B)。而且,在標(biāo)記基因中,CCR7僅在亞群03中表達(dá)(圖6C)。研究發(fā)現(xiàn)CCR7通過促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移、鼓勵(lì)蛋白酶分泌以及誘導(dǎo)血管生成和免疫抑制來促進(jìn)腫瘤發(fā)展,與本文發(fā)現(xiàn)一致,即CD8+ T和其他腫瘤免疫細(xì)胞水平降低并經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中出現(xiàn)明顯的免疫抑制。此外,GSVA結(jié)果顯示,亞群03富集的通路包括Hedgehog信號(hào)、Notch信號(hào)、血管生成和MYC通路,與腫瘤增殖和發(fā)展相關(guān)(圖6F)。這些結(jié)果表明,亞群03表達(dá)的標(biāo)記基因具有腫瘤基因的特征,可以促進(jìn)腫瘤增殖和轉(zhuǎn)移,同時(shí)引起腫瘤免疫抑制。亞群2的比例在轉(zhuǎn)移病灶中也顯著小于原發(fā)病灶(圖6B),NR4A3、DUSP4RGS1是表達(dá)較高的標(biāo)記基因(圖6C)。亞群2富集的通路包括凋亡、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)、氧化磷酸化和DNA修復(fù)(圖6F)。這些結(jié)果證實(shí)了亞群2中表達(dá)的標(biāo)記基因,如NR4A3,可以通過介導(dǎo)MT-2信號(hào)通路抑制前列腺癌轉(zhuǎn)移,顯示了與CD8+ T細(xì)胞亞群03相反的功能。這些結(jié)果表明,TMET細(xì)胞的異質(zhì)性和免疫抑制可能是前列腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的重要原因。對(duì)比之前的原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶之間的DEGs的功能富集通路分析顯示,這些基因主要集中在細(xì)胞質(zhì)翻譯、T細(xì)胞激活、正調(diào)控白細(xì)胞激活、免疫應(yīng)答調(diào)節(jié)、白細(xì)胞黏附等與免疫相關(guān)的通路中(圖6DE)。這些結(jié)果進(jìn)一步證明了前列腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移中CD8+ T細(xì)胞具有促使腫瘤進(jìn)展并導(dǎo)致免疫抑制的特征。


6 原發(fā)性和轉(zhuǎn)移性病變間CD8+T細(xì)胞的異質(zhì)性分析

 

6、原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移樣本中單核細(xì)胞的異質(zhì)性

         髓樣細(xì)胞是除淋巴樣細(xì)胞外TME中的另一個(gè)重要組成部分。在本研究中,共鑒定了1,203個(gè)單核細(xì)胞(原發(fā)病灶中的930個(gè),轉(zhuǎn)移病灶中的273個(gè)),而在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶中的單核細(xì)胞的數(shù)量和比例顯著小于原發(fā)病灶。單核細(xì)胞的UMAP分析確定了共計(jì)六個(gè)亞群(圖7A)。此外,在轉(zhuǎn)移病灶中,亞群1、2、45的細(xì)胞比例高于原發(fā)病灶(圖7B)。所有四個(gè)亞群中均發(fā)現(xiàn)BIRC3的過表達(dá),而亞群12同時(shí)過表達(dá)M1特征基因CCL3(圖7C)。此外,GSVA分析顯示亞群12富集了TNF-α信號(hào)、炎癥反應(yīng)和TGF-β信號(hào)通路。除了BIRC3之外,促進(jìn)腫瘤增殖和發(fā)展的特征基因,包括RPL31EREG,均在亞群12中表達(dá)(圖7C,F)。以上結(jié)果表明,亞群12可能是從M1M2的過渡階段,這與Azizi等人的研究結(jié)果一致,他們發(fā)現(xiàn)乳腺癌中一些TAM細(xì)胞群體高度表達(dá)了M1(如CCL3)和M2(如MARCONRP2)的特征基因。這意味著TME中的TAM分化也是一個(gè)連續(xù)和漸進(jìn)的過程,而不是傳統(tǒng)上認(rèn)為的兩個(gè)離散的狀態(tài)。此外,GSVA顯示亞群45富集了E2F、MYC、G2M、TNF-α信號(hào)和Hedgehog信號(hào)通路。以上結(jié)果表明,亞群45具有M2的特征。然而,在原發(fā)病灶中,亞群03的細(xì)胞比例顯著高于淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,暗示其可能具有抑制腫瘤的功能。GSVA結(jié)果表明蛋白分泌、氧化磷酸化、膽汁酸代謝等與代謝相關(guān)的通路主要富集在亞群03中(圖7C,F),表明這些細(xì)胞可能通過調(diào)節(jié)免疫和代謝來干擾TME。此外,原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶之間的單核細(xì)胞DEGs進(jìn)一步調(diào)查。DEGs的功能富集通路分析顯示,它們主要集中在免疫應(yīng)答激活、白細(xì)胞遷移、正調(diào)控細(xì)胞激活等與免疫相關(guān)的通路中(圖7D、E)。

 

7 原發(fā)性和淋巴轉(zhuǎn)移性前列腺癌TME中骨髓細(xì)胞的異質(zhì)性分析

 

7、纖維細(xì)胞的異質(zhì)性分析

         除免疫細(xì)胞外,TME還包含癌相關(guān)的纖維細(xì)胞(CAFs)、血管內(nèi)皮細(xì)胞、胞外基質(zhì)等非免疫細(xì)胞組分,這些也影響腫瘤免疫微環(huán)境的功能狀態(tài)。在本研究中,共鑒定了2,456個(gè)纖維細(xì)胞(原發(fā)病灶中的2,066個(gè),轉(zhuǎn)移病灶中的390個(gè))(表23)。纖維細(xì)胞的UMAP分析揭示共計(jì)五個(gè)亞群(圖8A)。在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶中,亞群34的細(xì)胞比例顯著高于原發(fā)病灶,表明亞群34的細(xì)胞與腫瘤的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移有關(guān)(圖8B)。進(jìn)一步研究這兩個(gè)亞群中表達(dá)的特征基因揭示其他亞群中共同表達(dá)的基因,如DCN、ATF3FLNA(圖8C)。更重要的是,在亞群34中特異表達(dá)的STEAP4ADGRF5顯示了CXCR4SRGN的顯著過表達(dá)(圖8C),這與TME中的腫瘤轉(zhuǎn)移或免疫抑制密切相關(guān)。對(duì)13例帶有淋巴轉(zhuǎn)移的前列腺癌的石蠟切片進(jìn)行的多色免疫熒光染色表明,CXCR4在原發(fā)腫瘤組織和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶中均為陽性,而在轉(zhuǎn)移病灶中的陽性率高于原發(fā)病灶,這與單細(xì)胞測序的結(jié)果一致。這表明在前列腺癌TME中存在CXCR4?+?纖維細(xì)胞(圖8D)。GSVA結(jié)果顯示,亞群34的纖維細(xì)胞中Hedgehog信號(hào)通路、血管生成和G2M通路顯著富集(圖8G),而這些通路的激活可能導(dǎo)致腫瘤的進(jìn)展。以上結(jié)果表明,表達(dá)STEAP4、ADGRF5CXCR4SRGN的纖維細(xì)胞亞群34經(jīng)歷了由轉(zhuǎn)錄重編程引起的顯著功能改變,與腫瘤的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移、腫瘤代謝和免疫抑制密切相關(guān),暗示著這些纖維細(xì)胞具有促進(jìn)前列腺癌轉(zhuǎn)移和進(jìn)展的能力。進(jìn)一步分析前列腺癌原發(fā)病灶和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移病灶之間的DEGs及其功能富集(圖8E-F),特別是在淋巴轉(zhuǎn)移灶中高度表達(dá)的DEGs,顯示在轉(zhuǎn)移灶中高度表達(dá)的DEGs包括與免疫相關(guān)的基因(CCL21、CCL19、CCL2MYC)、與代謝相關(guān)的基因(STEAP4、FABP4、DPTAPOE)以及與腫瘤增殖和進(jìn)展相關(guān)的基因(RGSCCNMYC)。DEGs的功能富集分析表明,這些DEGs主要富集在細(xì)胞質(zhì)翻譯、正調(diào)節(jié)細(xì)胞黏附、細(xì)胞外基質(zhì)組織以及參與調(diào)控細(xì)胞外基質(zhì)和免疫應(yīng)答的淋巴細(xì)胞激活的正調(diào)節(jié)等過程中??偟膩碚f,這些結(jié)果表明在PCaTME中存在明顯的成纖維細(xì)胞異質(zhì)性。一些成纖維細(xì)胞亞群表達(dá)與腫瘤和免疫相關(guān)的基因,這可能影響腫瘤的進(jìn)展并重塑TME中的腫瘤細(xì)胞和免疫細(xì)胞相互作用,從而促進(jìn)PCa的轉(zhuǎn)移。


8 原發(fā)性和淋巴轉(zhuǎn)移性前列腺癌TME中成纖維細(xì)胞的異質(zhì)性分析

 

8、PCa原發(fā)病變和淋巴轉(zhuǎn)移灶的細(xì)胞間通信

         為確定PCa原發(fā)病變和轉(zhuǎn)移灶之間細(xì)胞間通信的差異,進(jìn)行了CellChat分析。結(jié)果顯示,淋巴轉(zhuǎn)移灶中推斷的相互作用數(shù)目大于原發(fā)病變,而相互作用強(qiáng)度則相反。此外,在淋巴轉(zhuǎn)移灶中,間質(zhì)細(xì)胞與免疫細(xì)胞之間的相互作用更為緊密,而與原發(fā)病變相比,腔細(xì)胞之間的通信減弱(圖9A、B)。對(duì)PCa中的82個(gè)激活信號(hào)通路進(jìn)行了分析和鑒定,其中63個(gè)在原發(fā)病變和淋巴轉(zhuǎn)移灶中共享(圖9C、D),有9個(gè)是原發(fā)病變特有的,包括GDF、PARs、CDH、CADH、BMP、TGFb、CX3CDESMOSOMEWNT,其中GDFPARs更為活躍。在淋巴轉(zhuǎn)移灶中只存在的10個(gè)信號(hào)通路,包括CD22、CD45、IL16SPP1、LIGHTANGPTL、GRN、ncWNT、PERIOSTINNEGR,除了經(jīng)典的ncWNT通路可以促進(jìn)腫瘤進(jìn)展外,CD45CD22最為活躍(圖9C、D)??傮w而言,這些結(jié)果表明淋巴轉(zhuǎn)移灶中的細(xì)胞間通信可能導(dǎo)致TME中的免疫抑制狀態(tài)和腫瘤進(jìn)展。


9原發(fā)性和淋巴轉(zhuǎn)移性前列腺癌TME的細(xì)胞間通訊

 

實(shí)驗(yàn)方法:

         組織樣本收集,細(xì)胞系培養(yǎng),scRNA-seq分析,免疫組化(IHC),免疫熒光(IF),qRT-PCR,WB,Transwell實(shí)驗(yàn),EDU

參考文獻(xiàn):

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