目的:利用piRNA測序篩選新型乳腺癌預(yù)后生物標(biāo)記物
Piwi-interacting RNAs (piRNAs)是一類 26 到 32 nt 的非編碼小RNA,在維持生殖細(xì)胞系上發(fā)揮重要作用,目前還認(rèn)為其在體細(xì)胞中對基因表達(dá)起到轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的作用。Piwi蛋白是piRNA生物合成和作用途徑的中心,對基因的表達(dá)起表觀調(diào)控作用。piRNAs/PIWIs已被報(bào)道可作為多種癌癥的潛在生物標(biāo)記物,但其在乳腺癌中的作用尚未得到全面的研究。
研究者分別對來自104個(gè)病人的石蠟包埋乳腺腫瘤組織和11個(gè)凍存正常乳腺組織進(jìn)行小RNA測序。結(jié)果正常組織獲得10M reads數(shù),腫瘤組織獲得165M reads數(shù),piRNA序列總數(shù)4,207,022條,被注釋到676個(gè)piRNA上。發(fā)現(xiàn)25個(gè)差異表達(dá)的piRNA,包括17個(gè)上調(diào)和8個(gè)下調(diào)piNRA。
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