circRNA在糖尿病中介導視網膜血管功能障礙
最新circRNA文章——首次揭示circRNA在糖尿病中介導視網膜血管功能障礙
近期，來自復旦大學，南京醫(yī)科大學的研究人員發(fā)表了題為“Circular Non-Coding RNA HIPK3 Mediates Retinal Vascular Dysfunction in Diabetes Mellitus”（IF=19.3） 的文章，首次揭示circHIPK3在糖尿病引起的視網膜血管功能障礙中的關鍵作用和調控機制。
研究簡介
circRNA已被證明在血管性疾病、神經障礙和癌癥中異常表達，然而其在糖尿病誘導的血管內皮功能紊亂中的作用尚未見報道。作者利用采用qPCR、Sanger測序、northern blot等 檢測糖尿病相關應激的circHIPK3表達模式。MTT,EdU,transwell 和 matrigel assays體外檢測circHIPK3在視網膜內皮細胞功能中的作用。視網膜胰蛋白酶消化，血管通透性測定，ELISA測定法檢測circHIPK3在視網膜血管功能障礙中的作用。生物信息學分析、熒光素酶活性分析、RNA pull down、體內研究，揭示了circhipk3介導的視網膜血管功能障礙的機制。最后驗證circhipk3作為miRNA海綿吸附miR-30a-3p，增強VEGFC, FZD4和 WNT2的表達，參與調控視網膜血管功能障礙。
研究方案
1、cirRNA的篩選
根據報道，circHIPK3在人臍靜脈血管內皮細胞（HUVECs）中高表達。circBase 檢索發(fā)現(xiàn)HIPK3宿主基因可能產生20個circRNA，作者對這些候選的circRNA進行PCR鑒定發(fā)現(xiàn)人和小鼠的視網膜內皮細胞各存在4和2個circRNA, RNase R處理后檢測到2個人circRNA和1個小鼠circRNA。最后選擇與小鼠circRNA保守的人circHIPK3進行下一步驗證。
2、cirRNA的表達模式
作者利用qPCR和northern blot，sang測序，結合RNAse 處理驗證circHIPK3的客觀存在，利用核質分離PCR和FISH檢測circHIPK3的亞細胞定位。并驗證其在糖尿病小鼠模型和高糖細胞中高表達。
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