一些好用的tRFs數(shù)據(jù)庫
在幾個(gè)惡性腫瘤中發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)trna衍生的片段，參與細(xì)胞增殖、凋亡和侵襲性轉(zhuǎn)移。這些失調(diào)的片段能夠結(jié)合阿爾戈里的蛋白質(zhì)和皮維蛋白來調(diào)節(jié)基因表達(dá)。一些新發(fā)現(xiàn)的trna基因片段被認(rèn)為是治療癌癥的新生物標(biāo)記和治療靶點(diǎn)。本文綜述了不同亞型的trna-衍生片段的生物起源和生物學(xué)功能，并討論了它們在癌癥進(jìn)展中的分子機(jī)制。
tRFs（ tRNA-derived fragments）是來源于tRNA前體或成熟的tRNA的非編碼小片段。最近的一些研究表明tRFs在多種腫瘤中異常表達(dá)，有些tRFs參與了某些惡性腫瘤的細(xì)胞增殖、凋亡和侵襲轉(zhuǎn)移，這些差異表達(dá)的tRFs主要通過結(jié)合AGO蛋白及PIWI蛋白調(diào)控基因的表達(dá)。此外一些研究表明tRFs還可以做腫瘤的biomarker及治療靶點(diǎn)。隨著越來越多的研究者的關(guān)注，tRF將成為下一個(gè)非編碼RNA的研究熱點(diǎn)。接下來小編為大家介紹幾個(gè)tRF常用數(shù)據(jù)庫，方便大家進(jìn)行相關(guān)研究。
1、tRFdb http://genome.bioch.virginia.edu/trfdb/search.php
tRFdb數(shù)據(jù)庫主要收集了人,小鼠,線蟲等7個(gè)物種的tRFs序列,總共2513條序列,其中人的序列552條, 收集的序列不多. 該數(shù)據(jù)庫主要收集了tRF-1, tRF-3, tRF-5序列,并提供ID,序列兩種查詢方式.
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