三陰性乳腺癌中isomiRs和tRFs的作用研究
三陰性乳腺癌中isomiRs和tRFs的作用研究
Telonis AG and Riqoutsos I. Race disparities in the contribution of miRNA isoforms and tRNA-derived fragments to triple-negative breast cancer. Cancer Research, 2017. IF=9.122
三陰性乳腺癌（TNBC）是在白人和黑人婦女之間存在標志性差異的一種乳腺癌亞型。作者系統(tǒng)分析了TCGA數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)集，以研究ncRNAs調(diào)控mRNA的表達模式。作者研究了isomiRs和tRNA來源的片段（tRFs）。在正常的乳房組織中，作者發(fā)現(xiàn)在ncRNA和mRNA層面以及二者之間的關(guān)聯(lián)層面都有顯著性的結(jié)合作用。這種結(jié)合作用在TNBC中廣泛地被打斷：很多的mRNAs在正常乳房組織和伴有轉(zhuǎn)錄本或tRF失調(diào)的TNBC中差異表達。在TNBC患者中，isomiRs和tRFs參與的調(diào)節(jié)通路在不同種族間是不同的。來源于特定的miRNA基因位點和tRNA基因位點的多樣的isomiRs和tRFs與TNBC中存在的種族差異具有相關(guān)性。作者重點研究了種族特異的轉(zhuǎn)錄組，并挑選了差異表達的關(guān)鍵通路中的新陳代謝相關(guān)的MAPK通路和Wnt/β信號通路進行詳細研究。
研究路線：
研究結(jié)果：
圖1復合的種族和國家特異性轉(zhuǎn)錄組圖。
圖2 mRNA及其臨近基因的表達譜。
圖3 短的ncRNA和轉(zhuǎn)錄因子可解釋mRNA與種族的相關(guān)性。
圖4 isomiRs和tRFs可能是mRNA差異表達的誘因。
圖5 種族特異的與新陳代謝相關(guān)的基因及通路。
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