circRNA(環(huán)狀RNA)定量PCR

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circRNA(環(huán)狀RNA)定量PCR

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cirRNA熒光定量PCR實驗
    circRNA 是通過特殊的選擇性剪切產(chǎn)生封閉環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA。 circRNA不受RNA外切酶的影響,比線性RNA表達更穩(wěn)定。研究表明,某些特殊的 circRNA 分子富含 miRNA結(jié)合位點,在細胞中起到miRNA sponges的作用,進而解除 miRNA 對其靶基因的抑制作用。ciRS-7(CDR1a)包含 63 個保守的 miR-7結(jié)合位點,該 circRNA 在細胞中能夠有效吸附miR-7。而miR-7 作為關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子廣泛參與癌癥途徑,如抑制在乳腺癌、膠質(zhì)瘤等癌癥中表達顯著上調(diào)的Pak1的表達;miR-7 也能通過結(jié)合α-synuclein抑制其表達。這些研究暗示ciRS-7 通過ceRNA 機制調(diào)節(jié)miR-7的功能,是神經(jīng)系統(tǒng)疾病和癌癥治療的潛在靶點。

      圖1 cirRNA轉(zhuǎn)錄過程                            圖2 ciRs-7作用機制
由于cirRNA特殊結(jié)構(gòu)及其表達豐度低的原因,cirRNA定量PCR實驗還存在一定困難。本公司經(jīng)過特殊的引物設(shè)計、反轉(zhuǎn)錄過程及PCR擴增過程的實驗條件優(yōu)化,能夠高效定量檢測cirRNA的表達。
CirRNA定量PCR實驗流程如下:
1、樣品RNA抽提
2、RNA質(zhì)檢
3、RNA逆轉(zhuǎn)錄cDNA
4、cirRNA特殊引物設(shè)計及其調(diào)試

圖3 cirRNA divergent 引物設(shè)計
5、cirRNA PCR擴增
6、PCR數(shù)據(jù)統(tǒng)計
只要您提供樣本及待檢測的cirRNA名稱,本公司可為您完成后續(xù)的所有實驗。

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上海英拜生物科技有限公司
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