高分文章發(fā)表Small RNA 測序驗證miRNA潛在標記物

（Validating Alzheimer’s disease micro RNAs using next-generation sequencing.Alzheimer's & Dementia. 2016. IF=11.619 ）

阿爾茨海默病(AD)是世界保健系統(tǒng)的一大挑戰(zhàn)，生物標記物能夠為AD的早期診斷提供依據(jù)， 提高病人的護理質量。研究者之前已報道過54 個AD案例和22個健康者的 miRNA測序，為對新型 AD生物標記物進一步驗證， 研究者又利用Illumina HiSeq2000測序平臺對49 個AD患者 和55 個健康者，以及20個輕度認知障礙病人和90個多發(fā)性硬化癥病人的血液利用多重測序進行small RNA測序，每個通道測序6個樣本。

研究者先將AD和對照群體的miRNA進行比較, 獲得差異miRNA，并將研究重點放在當初已發(fā)表的12個miRNA標記物上；其次研究差異miRNA與臨床信息如治療的相關性；然后分析miRNA靶點獲得AD miRNA的核心調控網絡；最后還比較AD病人與輕度認知障礙病人和多發(fā)性硬化癥病人的差異。

測序結果每一個體獲得大約14 M reads數(shù)， 290個個體總共3.85 billion reads。 將AD患者與健康者比較，聯(lián)合之前的研究一共發(fā)現(xiàn)580個差異miRNA，其中本次研究獲得146個，有68個與之前的重疊。該研究驗證miRNA可作為AD生物標志物, 將有助于阿爾茨海默病的及早診斷和病人護理的改善。下一步的研究可用RT-PCR等技術對這些生物標志物進行大量臨床樣本的篩選和驗證。

圖1. 兩次研究中都呈差異表達的68 個miRNA分級聚類熱圖。

紅色個體代表AD患者，綠色代表健康者。

圖2. 核心調控網絡。中間的14個基因，每一個至少是五個miRNA的靶標。