高分文章發(fā)表Small RNA 測(cè)序驗(yàn)證miRNA潛在標(biāo)記物

（Validating Alzheimer’s disease micro RNAs using next-generation sequencing.Alzheimer's & Dementia. 2016. IF=11.619 ）

阿爾茨海默病(AD)是世界保健系統(tǒng)的一大挑戰(zhàn)，生物標(biāo)記物能夠?yàn)锳D的早期診斷提供依據(jù)， 提高病人的護(hù)理質(zhì)量。研究者之前已報(bào)道過54 個(gè)AD案例和22個(gè)健康者的 miRNA測(cè)序，為對(duì)新型 AD生物標(biāo)記物進(jìn)一步驗(yàn)證， 研究者又利用Illumina HiSeq2000測(cè)序平臺(tái)對(duì)49 個(gè)AD患者 和55 個(gè)健康者，以及20個(gè)輕度認(rèn)知障礙病人和90個(gè)多發(fā)性硬化癥病人的血液利用多重測(cè)序進(jìn)行small RNA測(cè)序，每個(gè)通道測(cè)序6個(gè)樣本。

研究者先將AD和對(duì)照群體的miRNA進(jìn)行比較, 獲得差異miRNA，并將研究重點(diǎn)放在當(dāng)初已發(fā)表的12個(gè)miRNA標(biāo)記物上；其次研究差異miRNA與臨床信息如治療的相關(guān)性；然后分析miRNA靶點(diǎn)獲得AD miRNA的核心調(diào)控網(wǎng)絡(luò)；最后還比較AD病人與輕度認(rèn)知障礙病人和多發(fā)性硬化癥病人的差異。

測(cè)序結(jié)果每一個(gè)體獲得大約14 M reads數(shù)， 290個(gè)個(gè)體總共3.85 billion reads。 將AD患者與健康者比較，聯(lián)合之前的研究一共發(fā)現(xiàn)580個(gè)差異miRNA，其中本次研究獲得146個(gè)，有68個(gè)與之前的重疊。該研究驗(yàn)證miRNA可作為AD生物標(biāo)志物, 將有助于阿爾茨海默病的及早診斷和病人護(hù)理的改善。下一步的研究可用RT-PCR等技術(shù)對(duì)這些生物標(biāo)志物進(jìn)行大量臨床樣本的篩選和驗(yàn)證。

圖1. 兩次研究中都呈差異表達(dá)的68 個(gè)miRNA分級(jí)聚類熱圖。

紅色個(gè)體代表AD患者，綠色代表健康者。

圖2. 核心調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。中間的14個(gè)基因，每一個(gè)至少是五個(gè)miRNA的靶標(biāo)。