測(cè)序在手,文章我有

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2019-08-05
circRNA被鑒定為多種癌癥中的重要調(diào)節(jié)因子,但在LUSC中尚未見報(bào)道。于是,一篇影響因子11.878、以測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)展開研究的文章應(yīng)運(yùn)而生......

肺鱗狀細(xì)胞癌(lung squamous cell carcinoma ,LUSC)是非小細(xì)胞肺癌的主要亞型之一,而非小細(xì)胞肺癌占所有人類肺癌的80-85%。circRNA被鑒定為多種癌癥中的重要調(diào)節(jié)因子,但在LUSC中尚未見報(bào)道。于是,這篇影響因子11.878、以測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)展開研究的文章應(yīng)運(yùn)而生。

研究思路如下:
說(shuō)明: E:\5.微信稿件+文獻(xiàn)\7.22-7.26\7.26.png


一、circTP63 is upregulated in LUSC. 測(cè)序發(fā)現(xiàn)circTP63在LUSC表達(dá)上調(diào).

1.通過(guò)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析及實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證,選定circTP63為研究對(duì)象

2.在35對(duì)臨床樣本中進(jìn)行驗(yàn)證

二、Characteristics of circTP63 in LUSC cells.分析circTP63序列

  1. 分析circTP63序列

  2. 檢測(cè)細(xì)胞系中circTP63的表達(dá),選定SW900、H1703用于功能缺失實(shí)驗(yàn), H226、H2170用于功能獲得實(shí)驗(yàn)

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三、circTP63 promotes cell proliferation and tumor growth. circTP63促進(jìn)細(xì)胞增殖和腫瘤增長(zhǎng)
   細(xì)胞實(shí)驗(yàn):

  1. 干擾 circTP63,抑制細(xì)胞生長(zhǎng)

  2. 過(guò)表達(dá)circTP63,提高細(xì)胞活力

  3. 挽救實(shí)驗(yàn),表明circTP63的確可以促進(jìn)細(xì)胞增殖

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   體內(nèi)實(shí)驗(yàn):
  利用H2170建立裸鼠異種移植模型,發(fā)現(xiàn)circTP63促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)。

四、circTP63 facilitates cell proliferation by targeting FOXM1.circTP63通過(guò)FOXM1促進(jìn)細(xì)胞增殖

  1. circTP63、mRNA共表達(dá)模式分析,得到25個(gè)可能的靶標(biāo)mRNA,其中FOXM1,KIF18B和BRCA1相關(guān)性位居前三

  1. 對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)FOXM1在LUSC中顯著上調(diào)

  1.  在35對(duì)臨床樣本中驗(yàn)證FOXM1的表達(dá),并檢測(cè)circTP63與mRNA表達(dá)的相關(guān)性,最終,選定FOXM1為主要候選目標(biāo)。


五、circTP63 relieves repression of miR-873-3p on FOXM1.circTP63具有ceRNA功能通過(guò)預(yù)測(cè)選定miR-873-3p后,利用熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)、免疫沉淀進(jìn)行驗(yàn)證。
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六、CENPA and CENPB are regulated by circTP63 through FOXM1.circTP63通過(guò)調(diào)控FOXM1進(jìn)而調(diào)控CENPA/B,促進(jìn)細(xì)胞增殖

  1. 過(guò)表達(dá)circTP63,檢測(cè)8個(gè)候選基因表達(dá)水平發(fā)現(xiàn),CENPA,CENPB, CCNB1受circTP63調(diào)節(jié)

  2. 干擾FOXM1,circTP63對(duì)CENPA和CENPB的作用顯著減弱

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3.敲除CENPA和CENPB同時(shí)過(guò)表達(dá)circTP63,circTP63對(duì)細(xì)胞增殖的促進(jìn)作用降低
 
綜上所訴,circTP63作為ceRNA調(diào)控FOXM1,促進(jìn)肺鱗狀細(xì)胞癌的發(fā)展。