三陰性乳腺癌中isomiRs和tRFs的作用研究

Telonis AG and Riqoutsos I. Race disparities in the contribution of miRNA isoforms and tRNA-derived fragments to triple-negative breast cancer. Cancer Research, 2017. IF=9.122
三陰性乳腺癌（TNBC）是在白人和黑人婦女之間存在標志性差異的一種乳腺癌亞型。作者系統(tǒng)分析了TCGA數據庫的數據集，以研究ncRNAs調控mRNA的表達模式。作者研究了isomiRs和tRNA來源的片段（tRFs）。在正常的乳房組織中，作者發(fā)現在ncRNA和mRNA層面以及二者之間的關聯層面都有顯著性的結合作用。這種結合作用在TNBC中廣泛地被打斷：很多的mRNAs在正常乳房組織和伴有轉錄本或tRF失調的TNBC中差異表達。在TNBC患者中，isomiRs和tRFs參與的調節(jié)通路在不同種族間是不同的。來源于特定的miRNA基因位點和tRNA基因位點的多樣的isomiRs和tRFs與TNBC中存在的種族差異具有相關性。作者重點研究了種族特異的轉錄組，并挑選了差異表達的關鍵通路中的新陳代謝相關的MAPK通路和Wnt/β信號通路進行詳細研究。
研究路線：

研究結果：

                                      圖1復合的種族和國家特異性轉錄組圖。

                                           圖2 mRNA及其臨近基因的表達譜。

                                            圖3 短的ncRNA和轉錄因子可解釋mRNA與種族的相關性。

                                        圖4 isomiRs和tRFs可能是mRNA差異表達的誘因。

                                        圖5 種族特異的與新陳代謝相關的基因及通路。