三陰性乳腺癌中isomiRs和tRFs的作用研究

 Telonis AG and Riqoutsos I. Race disparities in the contribution of miRNA isoforms and tRNA-derived fragments to triple-negative breast cancer. Cancer Research, 2017. IF=9.122
      三陰性乳腺癌（TNBC）是在白人和黑人婦女之間存在標(biāo)志性差異的一種乳腺癌亞型。作者系統(tǒng)分析了TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的數(shù)據(jù)集，以研究ncRNAs調(diào)控mRNA的表達(dá)模式。作者研究了isomiRs和tRNA來(lái)源的片段（tRFs）。在正常的乳房組織中，作者發(fā)現(xiàn)在ncRNA和mRNA層面以及二者之間的關(guān)聯(lián)層面都有顯著性的結(jié)合作用。這種結(jié)合作用在TNBC中廣泛地被打斷：很多的mRNAs在正常乳房組織和伴有轉(zhuǎn)錄本或tRF失調(diào)的TNBC中差異表達(dá)。在TNBC患者中，isomiRs和tRFs參與的調(diào)節(jié)通路在不同種族間是不同的。來(lái)源于特定的miRNA基因位點(diǎn)和tRNA基因位點(diǎn)的多樣的isomiRs和tRFs與TNBC中存在的種族差異具有相關(guān)性。作者重點(diǎn)研究了種族特異的轉(zhuǎn)錄組，并挑選了差異表達(dá)的關(guān)鍵通路中的新陳代謝相關(guān)的MAPK通路和Wnt/β信號(hào)通路進(jìn)行詳細(xì)研究。
研究路線：

研究結(jié)果：

圖1復(fù)合的種族和國(guó)家特異性轉(zhuǎn)錄組圖。

圖2 mRNA及其臨近基因的表達(dá)譜。

圖3 短的ncRNA和轉(zhuǎn)錄因子可解釋mRNA與種族的相關(guān)性。

圖4 isomiRs和tRFs可能是mRNA差異表達(dá)的誘因。

圖5 種族特異的與新陳代謝相關(guān)的基因及通路。