MAZTER-seq:不一樣的m6A研究方法

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2019-10-12
m6A(N6-methyladenosine)是mRNA的修飾方式之一,在發(fā)育、生理和疾病中起關(guān)鍵作用......

m6A(N6-methyladenosine)是mRNA的修飾方式之一,在發(fā)育、生理和疾病中起關(guān)鍵作用。m6A的研究一直以來存在一個(gè)問題:m6A化學(xué)計(jì)量無法量化。接下來提到的方法很好的解決了這一問題。Garcia-Campos等人開發(fā)了MAZTER-seq,這一方法不僅可以從頭檢測m6A位點(diǎn),對甲基化進(jìn)行定量,還可以對亞細(xì)胞、不同類型細(xì)胞以及疾病不同狀態(tài)的m6A進(jìn)行定量分析。
MAZTER-seq是基于一種RNA酶MazF。這種還酶特異性從頭切割無甲基化修飾的ACA位點(diǎn),對酶處理過的片段經(jīng)處理后進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,對cDNA產(chǎn)物進(jìn)行測序

對測序結(jié)果進(jìn)行分析計(jì)算,量化m6A:

該方法的局限之一在于,只能識別ACA位點(diǎn)的甲基化,而ACA只占DRACH的16%左右。但無論如何,這一方法的發(fā)表推動了m6A研究領(lǐng)域的發(fā)展,為m6A的研究提供了新思路。