DREIMT:根據(jù)轉錄組學數(shù)據(jù)在線分析能夠調節(jié)免疫細胞活性的藥物

欄目:最新研究動態(tài) 發(fā)布時間:2021-09-27
DREIMT (http://www.dreimt.org/)整合了來自LINCS L1000 數(shù)據(jù)集的 4,694 個藥物概況和來自多種資源的......


DREIMT http://www.dreimt.org/)整合了來自LINCS L1000 數(shù)據(jù)集的 4,694 個藥物概況和來自多種資源的 2,687 個免疫基因表達特征,以生成藥物——免疫特征關聯(lián)數(shù)據(jù)庫。除此以外,DREIMT 還可以根據(jù)用戶提供的免疫特征對藥物關聯(lián)進行優(yōu)先排序。


l  Drug prioritization


      該模塊可以查詢特定的基因,也可以上傳數(shù)據(jù)進行分析。如果使用基因列表進行查詢,則需要輸入15 - 200 個與 DREIMdb 藥物譜基因匹配的基因名。結果圖、表可以進行下載。tau90FDR0.05的基因為最佳候選基因。


l  Signature comparison


 該模塊是通過測試用戶提供的基因表達特征和 DREIMTdb 特征之間是否存在顯著的基因重疊來探索最相似的藥物關聯(lián)。


l 
Database



在該模塊可以根據(jù)細胞類型、藥物作用、藥物名稱等信息查詢該數(shù)據(jù)庫中相關信息。結果頁面中,可以點擊相關列跳轉至參考文獻等頁面。