miRWalk:microRNA綜合數(shù)據(jù)庫

miRWalk數(shù)據(jù)庫是一個集miRNA查詢、miRNA靶基因及pathway查詢于一體的在線、免費數(shù)據(jù)庫。包括人、大鼠、小鼠、狗、牛和魚6物種。

l  miRNA查詢

       首先選擇要查詢物種，然后輸入miRNA名稱（注意名稱中使用“-”而非下劃線），可以獲取miRNA序列及靶基因列表。miRWalk中靶基因列表可以點擊“Export”輸出為csv格式文件。

如果按基因查詢，可以輸入基因名、基因ID等。查詢結(jié)果將顯示基因基本信息及靶向該基因的miRNA列表。

l  Target Mining

該模塊可以對多個 miRNA /基因/特定通路進(jìn)行搜索。

       根據(jù)miRNA列表搜索，需要選擇物種、ID類型。結(jié)果頁面為靶基因列表，“Graph”為網(wǎng)絡(luò)圖結(jié)果，GSEA可以在KEGG、GO層面對靶基因進(jìn)行富集分析。（根據(jù)基因搜索步驟、結(jié)果頁內(nèi)容與miRNA相同）

      根據(jù)Pathway搜索，選擇物種、數(shù)據(jù)庫之后，下拉列表選擇特定的通路即可查詢。結(jié)果頁面為靶向該通路中所有基因的miRNA。