CSEA-DB：細胞類型特異性富集分析數(shù)據(jù)庫

CSEA-DB 是系統(tǒng)探索人類復雜特征和細胞類型關(guān)聯(lián)的綜合工具，包括了 752 種組織細胞類型中 13,756 組性狀相關(guān)基因 (TAG) 組特異性表達的細胞類型的 CSEA 結(jié)果?？傮w而言，CSEA-DB 以細胞分辨率精細繪制了遺傳信號，并闡明了人類復雜性狀和疾病的潛在機制。

鏈接：

https://bioinfo.uth.edu/CSEADB/index.php?csrt=14316269507315431

l  Home

   在主頁中，用戶可以單擊器官圖標以查找具有單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組織; 在右側(cè)，用戶可以通過在“Quck search”輸入與組織、細胞類型或性狀相關(guān)的關(guān)鍵詞進行信息搜索；用戶可以在“Browse”部分探索組織-細胞類型關(guān)系。

l  Multi-traits

      第一步：選擇感興趣的“細胞類型”。 A) 方法一：輸入關(guān)鍵詞。 B) 方法：單擊以從組織及其細胞類型列表中進行選擇。

        第二步：輸入感興趣的疾病或性狀。用戶一次搜索最多只能選擇 10 個。

點擊“submit”,頁面將轉(zhuǎn)到“Multi-traits”和CSEA結(jié)果熱圖

l  scExpression

       該頁面提供組織和細胞類型級別的標準化基因表達信息。用戶可以提交一個感興趣的基因，頁面將返回 68 項組織研究中每一項的平均 CPM 標準化基因表達的概述（條形圖）。進一步單擊感興趣的組織條和條形圖可以獲取該組織中每種細胞類型的平均 CPM 標準化表達。繪圖和表達式數(shù)據(jù)均可下載。

l  Search

       功能支持對感興趣的性狀名稱、組織和細胞類型進行搜索，返回頁包括與關(guān)鍵字相關(guān)的所有可能的結(jié)果。