CSEA-DB：細(xì)胞類型特異性富集分析數(shù)據(jù)庫(kù)

CSEA-DB 是系統(tǒng)探索人類復(fù)雜特征和細(xì)胞類型關(guān)聯(lián)的綜合工具，包括了 752 種組織細(xì)胞類型中 13,756 組性狀相關(guān)基因 (TAG) 組特異性表達(dá)的細(xì)胞類型的 CSEA 結(jié)果?？傮w而言，CSEA-DB 以細(xì)胞分辨率精細(xì)繪制了遺傳信號(hào)，并闡明了人類復(fù)雜性狀和疾病的潛在機(jī)制。

鏈接：

https://bioinfo.uth.edu/CSEADB/index.php?csrt=14316269507315431

l  Home

   在主頁(yè)中，用戶可以單擊器官圖標(biāo)以查找具有單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的組織; 在右側(cè)，用戶可以通過(guò)在“Quck search”輸入與組織、細(xì)胞類型或性狀相關(guān)的關(guān)鍵詞進(jìn)行信息搜索；用戶可以在“Browse”部分探索組織-細(xì)胞類型關(guān)系。

l  Multi-traits

      第一步：選擇感興趣的“細(xì)胞類型”。 A) 方法一：輸入關(guān)鍵詞。 B) 方法：?jiǎn)螕粢詮慕M織及其細(xì)胞類型列表中進(jìn)行選擇。

        第二步：輸入感興趣的疾病或性狀。用戶一次搜索最多只能選擇 10 個(gè)。

點(diǎn)擊“submit”,頁(yè)面將轉(zhuǎn)到“Multi-traits”和CSEA結(jié)果熱圖

l  scExpression

       該頁(yè)面提供組織和細(xì)胞類型級(jí)別的標(biāo)準(zhǔn)化基因表達(dá)信息。用戶可以提交一個(gè)感興趣的基因，頁(yè)面將返回 68 項(xiàng)組織研究中每一項(xiàng)的平均 CPM 標(biāo)準(zhǔn)化基因表達(dá)的概述（條形圖）。進(jìn)一步單擊感興趣的組織條和條形圖可以獲取該組織中每種細(xì)胞類型的平均 CPM 標(biāo)準(zhǔn)化表達(dá)。繪圖和表達(dá)式數(shù)據(jù)均可下載。

l  Search

       功能支持對(duì)感興趣的性狀名稱、組織和細(xì)胞類型進(jìn)行搜索，返回頁(yè)包括與關(guān)鍵字相關(guān)的所有可能的結(jié)果。