SC2diseases：人類疾病相關單細胞測序數(shù)據(jù)庫

轉錄組在維持細胞身份和細胞分化過程中的時空特異性方面起著至關重要的作用，從而對任何生物體的形成和調節(jié)復合物產(chǎn)生深遠的影響。單細胞 RNA 測序 (scRNA-seq) 技術在過去幾年得到了迅速發(fā)展，這使得能夠以單細胞分辨率研究復雜多細胞生物的轉錄組學特征，用以研究表達模式中的細胞異質性，深入了解導致正常細胞在不同疾病中變成惡性細胞的原因。SC2diseases是一個源自大量人類研究的 scRNA-seq 數(shù)據(jù)庫。這個新穎的數(shù)據(jù)庫將為研究人員提供基因、細胞和疾病水平的生物標志物。

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主頁用于展示該數(shù)據(jù)庫的基本信息：收據(jù)庫收錄了22種人類疾病在內的單細胞測序數(shù)據(jù)

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用戶可以點擊特定疾病或細胞類型瀏覽單細胞測序信息。

       點擊“＋”將展示數(shù)據(jù)庫收錄的疾病、細胞，單擊后將在頁面右側顯示基因、文獻等詳細信息，點擊左上角可進行下載。

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       用戶可以輸入感興趣的疾病/基因/細胞類型進行查詢

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該模塊可以用于比較疾病和非疾病狀態(tài)下各種類型細胞的表達譜。

       用戶可以輸入感興趣的疾病或基因，點擊“Search”將在頁面右側顯示表達譜。其中l(wèi)ogFC為上下調倍數(shù)，p_val、p_val_adj可以用于判斷上下調是否具有顯著差異（一般以＜0.05作為有顯著差異的判斷標準）。

      選擇感興趣的疾病，點擊“Display”可以看到基因SNP信息，點擊“Visualize”以圖形形式進行展示。

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      該數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)均可免費下載。