LnCeCell：lncRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫(kù)

在腫瘤微環(huán)境中，由于基因表達(dá)和調(diào)控的微調(diào)，細(xì)胞表現(xiàn)出不同的細(xì)胞行為。 細(xì)胞特異性基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的識(shí)別將有助于我們了解單個(gè)細(xì)胞的疾病病理，進(jìn)一步為精準(zhǔn)醫(yī)療做出貢獻(xiàn)。

為了根據(jù)“One Cell，One World”的觀點(diǎn)打開(kāi)疾病個(gè)性化表征的新大門(mén)，研究人員構(gòu)建了綜合數(shù)據(jù)庫(kù) LnCeCell，該數(shù)據(jù)庫(kù)記錄了來(lái)自25種癌癥、細(xì)胞特異性 lncRNA 相關(guān)的 ceRNA 網(wǎng)絡(luò)和基于高質(zhì)量已發(fā)表的文獻(xiàn)和單細(xì)胞基因組學(xué)數(shù)據(jù)的生物標(biāo)志物。http://www.bio-bigdata.net/LnCeCell/

該數(shù)據(jù)庫(kù)主要有以下7個(gè)分析模塊，因?yàn)椴僮鞅容^簡(jiǎn)單，所以接下來(lái)為您介紹其中的3個(gè)模塊：

1. Cell Map

點(diǎn)擊“CeRNA”，可以根據(jù)lncRNA/mRNA進(jìn)行搜索；點(diǎn)擊“Cell”,可以根據(jù)細(xì)胞類(lèi)型進(jìn)行搜索。結(jié)果頁(yè)面的圖片均可下載。

2. Cell Location

該模塊可以查詢(xún)ceRNA的亞細(xì)胞定位。紅框標(biāo)注的細(xì)胞器為該基因在細(xì)胞中的定位：

3. Cell Network

該模塊可以對(duì)lncRNA的ceRNA網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化展示：

該數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的數(shù)據(jù)均可進(jìn)行免費(fèi)下載：