LiqBioer：人工管理的體液中癌癥生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)庫

癌癥生物標(biāo)志物是可測量的指標(biāo)，在臨床應(yīng)用中起著至關(guān)重要的作用。自液體活檢發(fā)展以來，體液中的生物標(biāo)志物引起了相當(dāng)大的關(guān)注，其數(shù)據(jù)量也在迅速增加。 然而，盡管有少量小規(guī)模和特定的數(shù)據(jù)資源，但目前的研究缺乏將已發(fā)表的癌癥體液生物標(biāo)志物匯編成一個(gè)集中且可持續(xù)的研究人員和臨床醫(yī)生存儲(chǔ)庫。 為了實(shí)現(xiàn)這一目的，研究人員開發(fā)了LiqBioer，其中包含來自 3447 項(xiàng)研究的 6231 條人工整理記錄，涵蓋 22 個(gè)組織中的 3056 種生物標(biāo)志物和 74 種癌癥。

LiqBioer 允許用戶瀏覽和下載有關(guān)體液生物標(biāo)志物的綜合信息，包括癌癥類型、來源研究和臨床使用。

http://www.medsysbio.org:8080/LiqBioer/

l  Quick Search

在Home頁提供快速查詢功能。用戶輸入感興趣的標(biāo)志物（基因名、細(xì)胞、）或疾病名稱，單擊回車鍵進(jìn)行查詢即可。以TP53為例：

結(jié)果頁面中除顯示疾病、相關(guān)藥物等信息，還可以點(diǎn)擊“PMID”查看相關(guān)文獻(xiàn)支持：

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該模塊允許用戶通過點(diǎn)擊卡片來瀏覽生物標(biāo)志物的不同方面，包括標(biāo)志物、癌癥類型、藥物信息、標(biāo)志物得分、其他物種相關(guān)信息。

以“Cancer Types”為例，單擊該卡片跳轉(zhuǎn)至以下頁面，選擇相應(yīng)的部位，如“Brain”：

頁面跳轉(zhuǎn)至腦部相關(guān)的標(biāo)志物詳情頁，點(diǎn)擊“PMID”可以查看相關(guān)文獻(xiàn)支持：

l  Search

與“Quick Search”相比，該模塊支持更詳細(xì)的搜索條件。用戶可以在A區(qū)中選擇物種、體液類型、臨床用法及標(biāo)志物類型，然后在B區(qū)中輸入標(biāo)志物名稱或者癌癥類型，點(diǎn)擊“search”進(jìn)行搜索：

結(jié)果如下所示：

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點(diǎn)擊“Format”選項(xiàng)，根據(jù)需求選擇下載txt或者xlsx格式即可：