N-糖基化和二硫鍵的形成是蛋白質(zhì)折疊的兩個(gè)重要步驟,它們發(fā)生在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(ER)中,相互影響。本研究為分析N-糖基化和氧化之間的相互作用,研究了蛋白質(zhì)二硫氧化酶ERO1-α如何影響血管生成VEGF121的糖基化,VEGF121是血管穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子。本研究揭示ERO1丟失對(duì)蛋白質(zhì)N-糖基化的影響不僅與血管生成有關(guān),而且與其他癌癥病理機(jī)制有關(guān)。本研究于2022年10月發(fā)表在《Redox Biology》IF:10.787期刊上。
技術(shù)路線:
實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
1、ERO1敲除的細(xì)胞氧化能力減弱氧化鍵形成受損
為了跟蹤WT和ERO1 KO HeLa細(xì)胞中ER的氧化還原平衡,利用比例氧化還原傳感器ER定位的roGFP2。如圖1A所示,在WT和ERO1 KO細(xì)胞中,DTT刺激后ER roGFP2迅速減少;然而,在還原劑的洗脫過程中,ERO1 KO細(xì)胞表現(xiàn)出較慢的恢復(fù)速度,而WT細(xì)胞的氧化平衡恢復(fù)得很快,ERO1 KO細(xì)胞在40分鐘內(nèi)未達(dá)到WT細(xì)胞的氧化平衡基線值,這表明缺乏ERO1會(huì)損害ER的氧化平衡。
為評(píng)估ERO1缺失對(duì)ER中二硫鍵形成速率的影響,作者構(gòu)建了FLAG-VEGF121,它被組裝成二硫連接的同型二聚體(圖1B),并比較了在WT和ERO1 KO細(xì)胞中,在蛋白合成抑制劑CHX脈沖作用后,細(xì)胞內(nèi)形成二硫連接的同型二聚體的速率。結(jié)果顯示,F(xiàn)LAG-VEGF121在WT和ERO1 KO細(xì)胞中的積累程度相似;然而,雖然在WT細(xì)胞中二聚體是所有時(shí)間點(diǎn)的主要物質(zhì),但在ERO1 KO細(xì)胞中,二聚體的生成速度較慢,單體在沖洗過程中積累,表明單體轉(zhuǎn)化為二聚體的速度較慢(圖 1C)。 因此,由ERO1損失引起的氧化平衡的改變轉(zhuǎn)化為 VEGF121 二硫鍵形成速率的損害。
圖1ERO1 KO細(xì)胞中氧化能力受損和VEGF121二硫鍵形成延遲
2、ERO1 KO細(xì)胞分泌的VEGF121無鏈內(nèi)二硫鍵的缺陷而是N75上高糖基化
為分析WT和ERO1 KO HeLa細(xì)胞分泌的FLAG-VEGF121,收集兩細(xì)胞系的條件培養(yǎng)基,用N -乙基馬來酰亞胺(NEM)烷基化,然后用FLAG-M1抗體免疫沉淀。免疫沉淀采用非還原SDS-PAGE分析。經(jīng)考馬斯藍(lán)染色發(fā)現(xiàn)WT細(xì)胞的FLAG-VEGF121有三個(gè)主要條帶,對(duì)應(yīng)于VEGF121的二聚體和寡聚體,而ERO1 KO細(xì)胞的FLAG-VEGF121只有兩個(gè)條帶,即一個(gè)微弱的寡聚體和一個(gè)比WT細(xì)胞分泌的慢的遷移二聚體(圖2A)。從凝膠中分離這些條帶,DTT還原并用碘乙酰胺(IAA)烷基化,這一處理導(dǎo)致二硫鍵中半胱氨酸被標(biāo)記,導(dǎo)致氨基甲基(CAM)富集,最后進(jìn)行nLC-ESI-MS/MS(圖2B)。裂解肽的質(zhì)譜顯示,WT和ERO1 KO分泌的FLAG-VEGF121在NEM和IAA肽烷基化方面沒有太大差異。例如,參與VEGF121鏈內(nèi)二硫鍵的C68只以氧化形式存在于WT和ERO1 KO細(xì)胞的VEGF121中;C102也參與VEGF121的鏈內(nèi)二硫鍵,在WT和ERO1 KO細(xì)胞的VEGF121中均以混合還原和氧化狀態(tài)檢測(cè)到,這表明在ERO1 KO細(xì)胞中FLAG-VEGF121的分子內(nèi)二硫鍵沒有缺陷(圖2B)。
使用NetNGlyc在線軟件預(yù)測(cè)VEGF121 氨基酸序列的共有序列 NIT 內(nèi)75號(hào)位處存在N-糖基化位點(diǎn)。因此,作者假設(shè)圖2A遷移較慢的條帶是N-糖基化的產(chǎn)物,并使用糖苷內(nèi)切酶對(duì)此進(jìn)行測(cè)試。如圖2C所示,WT和ERO1 KO細(xì)胞的FLAG-VEGF121對(duì)內(nèi)糖苷酶H (ENDO H)不敏感,但對(duì)肽- N -糖苷酶F (PNGase F)敏感,導(dǎo)致快速遷移的蛋白質(zhì)消失。這些結(jié)果表明,遷移較慢的多肽含有N -鏈寡糖,在高爾基體中已經(jīng)成熟,從而獲得了對(duì)EndoH的抗性。用PNGase F(一種酰胺酶)處理后,糖基化Asn殘基被脫酰胺。對(duì)WT和ERO1 KO細(xì)胞中FLAG-VEGF121二聚體和寡聚體的片段肽進(jìn)行質(zhì)譜分析,然后用PNGase F酶切,證實(shí)天冬酰胺N75被糖基化,除了來自WT細(xì)胞的低聚物2(圖2D)。挽救實(shí)驗(yàn)證實(shí)了ERO1在限制糖基化中的作用。在 ERO1 KO 細(xì)胞中轉(zhuǎn)染ERO1或其高活性突變體ERO1C131A的表達(dá)質(zhì)粒,通過改變糖基化形式占總量的 80% 至 40%,拯救了ERO1 KO細(xì)胞分泌的FLAG-VEGF121的N-高糖基化(圖2E)。
圖2 ERO1 KO細(xì)胞分泌的VEGF121鏈內(nèi)二硫鍵和N-高糖基化
3、ERO1 KO細(xì)胞VEGF121的N75高糖基化導(dǎo)致分泌動(dòng)力學(xué)缺陷
接下來比較VEGF121在WT和ERO1 KO細(xì)胞的分泌動(dòng)力學(xué),并研究N-高糖基化如何影響這一過程。結(jié)果發(fā)現(xiàn)ERO1 KO細(xì)胞分泌VEGF121的動(dòng)力學(xué)受損,在最后兩個(gè)時(shí)間點(diǎn)達(dá)到平臺(tái)期(圖3A)。為研究該損傷是否由于高糖基化,構(gòu)建一個(gè)突變體,其中N75被Gln殘基(N75Q)取代。發(fā)現(xiàn)VEGF121突變體在WT和ERO1 KO細(xì)胞中表達(dá)時(shí)都沒有糖基化(圖3B)。值得注意的是,該突變體在WT和ERO1 KO細(xì)胞中的分泌動(dòng)力學(xué)相當(dāng),而在ERO1 KO細(xì)胞中的分泌受影響較?。▓D3C-3D),表明N75的高糖基化是ERO1 KO細(xì)胞中FLAG-VEGF121分泌受損的基礎(chǔ)。
圖3 ERO1 KO細(xì)胞分泌的VEGF121的N75高糖基化損害其其分泌動(dòng)力學(xué)
4、VEGF121在ERO1 KO細(xì)胞中仍具有受體能力但在缺氧條件下受體能力喪失
突變?yōu)镕LAG-VEGF121的C60 (C60S)或C68 (C68S)絲氨酸,分別參與鏈間和鏈內(nèi)二硫鍵(圖1B),增加了WT細(xì)胞分泌的VEGF121的N-糖基化,表明VEGF中二硫鍵形成的受損改善了其N -糖基化(圖4A)。與未突變的VEGF121相比,WT細(xì)胞中C60的分泌不受影響,而C68的分泌受損60%(圖4A)。當(dāng)ERO1 KO細(xì)胞分泌兩種突變體C60和C68時(shí),未觀察到高糖基化,表明ERO1缺失是VEGF121糖基化的主要影響。與相同細(xì)胞中未突變的VEGF121相比,ERO1 KO細(xì)胞中C60的分泌不受影響,而C68的分泌受損85%,WT細(xì)胞中C68的分泌受損更嚴(yán)重(圖4A)。
利用表面等離子體共振(SPR)來確定Aflibercept的不同形式VEGF121的相對(duì)解離常數(shù)(KD),這是一種親和力的測(cè)量方法,Aflibercept是人IgG1的Fc區(qū)與VEGF兩受體VEGFR1和R2之間的融合蛋白。結(jié)果表明,ERO1 KO細(xì)胞分泌的VEGF121對(duì)受體的親和力大約是WT細(xì)胞分泌的VEGF121的2倍(但無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異),但突變的VEGF121 C60S的親和力是WT細(xì)胞分泌的VEGF121 C68S的6倍,而突變的VEGF121 C68S則完全不與受體結(jié)合。表明,來自ERO1 KO細(xì)胞的VEGF121仍然具有受體活性,排除了其大規(guī)模氧化展開的可能(圖4B)。
在低氧條件下,WT細(xì)胞分泌的VEGF121在糖基化或分泌量方面與正常缺氧條件下分泌的VEGF121相比,差異可以忽略不計(jì)(圖4C)。此外,其KD在數(shù)量上與常氧條件下分泌的對(duì)應(yīng)物相似(圖4D)。相反,在缺氧條件下,ERO1 KO細(xì)胞中VEGF121的分泌量受到嚴(yán)重影響(圖4C),這表明在ERO1缺失的條件下,VEGF121的成熟和分泌特別依賴氧氣。此外,KD降低兩倍表明缺氧條件下ERO1 KO細(xì)胞VEGF121受體能力進(jìn)一步受損(圖4D)。
圖4 ERO1 KO細(xì)胞的VEGF121具有受體能力但在缺氧條件下其受體能力受損
5、VEGF121和STT3B之間加強(qiáng)的聯(lián)系導(dǎo)致ERO1 KO細(xì)胞的高糖基化
正如已經(jīng)觀察到的,在ERO1 KO細(xì)胞中,細(xì)胞內(nèi)VEGF121以及分泌形式都是高糖基化的。然而,與分泌型VEGF121不同的是,N-糖基化的細(xì)胞內(nèi)形式對(duì)EndoH和PNGaseF都敏感(圖5A)。在WT和ERO1 KO細(xì)胞中,VEGF121對(duì)兩種內(nèi)糖苷酶的敏感性沒有差異,這表明在穩(wěn)定狀態(tài)下,兩種細(xì)胞系中大多數(shù)細(xì)胞內(nèi)VEGF121都沒有通過高爾基體過渡。細(xì)胞內(nèi)FLAG-VEGF121 C68S和C68S的表現(xiàn)與WT細(xì)胞中高糖基化的分泌對(duì)應(yīng)物非常相似,與ERO1 KO中的原生形式?jīng)]有相關(guān)差異(圖5B)。為從分子層面深入了解VEGF121高糖基化的原因和/或后果,分析了VEGF121在WT和ERO1 KO細(xì)胞中的相互作用物。轉(zhuǎn)染VEGF121、VEGF121C60S和VEGF121C68S的WT和ERO1 KO細(xì)胞的蛋白裂解物用FLAG M1抗體免疫沉淀后SDS-PAGE電泳。在考馬斯藍(lán)凝膠中,可以看到貫穿泳道的一系列條帶(圖5C)。
圖5 在ERO1 KO和半胱氨酸突變體中細(xì)胞內(nèi)VEGF121高糖基化
對(duì)圖5C的每個(gè)泳道進(jìn)行單獨(dú)的切除和消化,將洗脫后的多肽進(jìn)行nLC-ESI MS/MS分析,從而鑒定出VEGF121相互作用分子。對(duì)ERO1 KO細(xì)胞中VEGF121、VEGF121C60S和VEGF121C68S相互作用分子的通路分析表明,主要富集至通過天冬酰胺進(jìn)行N-鏈糖基化的通路(圖6A)。研究發(fā)現(xiàn),在ERO1 KO細(xì)胞中,含有硫氧還蛋白結(jié)構(gòu)域的STT3B復(fù)合物亞基MAGT1與所有三個(gè)VEGF121相互作用(圖6B)?;诖?,作者決定關(guān)注VEGF121C68S,因?yàn)镃68中的突變是最接近糖基化Asn的,因此,其糖基化應(yīng)該受MAGT1影響較小。免疫沉淀證實(shí),VEGF121和VEGF121C68S在WT和ERO1 KO細(xì)胞中均存在MAGT1免疫反應(yīng)帶(圖6C)。用MAGT1-HA轉(zhuǎn)染的WT和ERO1 KO細(xì)胞的NEM烷基化允許在非還原免疫印跡上解析 MAGT1 的不同氧化還原形式。來自ERO1 KO細(xì)胞的MAGT1出現(xiàn)在大約52 kDa的緩慢遷移帶中,這在 WT 細(xì)胞中不可見,表明 MAGT1 在 ERO1 KO 細(xì)胞中的氧化還原介導(dǎo)的相互作用(圖6D)。在WT和ERO1 KO細(xì)胞中,MAGT1和STT3B的缺失導(dǎo)致VEGF121和VEGF121C68S的低糖基化,表明VEGF121及其突變體都是STT3B/MAGT1的底物(圖6E)。然而,VEGF121C68S(最接近天冬酰胺的半胱氨酸突變體)的N-糖基化對(duì) STT3B/MAGT1干擾不敏感。這些發(fā)現(xiàn)表明,ERO1缺失通過MAGT1增強(qiáng)了STT3B與VEGF121底物之間的相互作用,導(dǎo)致其N-高糖基化。
圖6 ERO1-KO細(xì)胞中VEGF121及其半胱氨酸突變體與MAGT1的相互作用增強(qiáng)
6、缺乏ERO1的乳腺腫瘤異種移植瘤顯示糖基化改變
為探究ERO1在腫瘤中的生理性影響,構(gòu)建ERO1缺失或未缺失的三陰性乳腺腫瘤模型。用兩種具有不同糖特異性的凝集素:小麥胚芽凝集素(WGA)和隔離素B4(IB4)對(duì)異種移植物切片進(jìn)行染色。結(jié)果如圖7所示,雖然IB4染色在兩種基因分化腫瘤中表現(xiàn)相似,但ERO1 KO細(xì)胞中的WGA染色平均比WT細(xì)胞高1.5倍,并在KO細(xì)胞中表現(xiàn)出斑片狀聚集模式。對(duì)這些腫瘤簇所占體積的定量分析顯示KO腫瘤與WT腫瘤相比增加了5倍,表明ERO1缺陷在調(diào)節(jié)糖基化方面具有廣泛的作用。
圖7 ERO1-KO乳腺腫瘤表現(xiàn)為N-高-糖基化蛋白模式
綜上所述,本研究證實(shí)ERO1缺失會(huì)導(dǎo)致較少的氧化ER氧化還原平衡。這導(dǎo)致 VEGF121中二硫鍵形成延遲,這有利于其N-高糖基化并增加MAGT1捕獲潛力,進(jìn)一步增加其在N75上的糖基化。這反過來減慢了ERO1耗盡細(xì)胞中生長(zhǎng)因子的分泌,如圖8所示。
圖5 機(jī)制模式圖
參考文獻(xiàn):
Varone Ersilia., Chernorudskiy Alexander., Cherubini Alessandro., Cattaneo Angela., Bachi Angela., Fumagalli Stefano., Erol Gizem., Gobbi Marco., Lenardo Michael J., Borgese Nica., Zito Ester.(2022). ERO1 alpha deficiency impairs angiogenesis by increasing N-glycosylation of a proangiogenic VEGFA. Redox Biol, 56(undefined), 102455. doi:10.1016/j.redox.2022.102455