MethMarkerDB：癌癥DNA甲基化生物標(biāo)志物數(shù)據(jù)庫

       DNA甲基化已成為癌癥研究中一個(gè)很有前途的生物標(biāo)志物。然而，確定臨床相關(guān)生物標(biāo)志物的準(zhǔn)確基因組位置仍然是一項(xiàng)具有挑戰(zhàn)性的任務(wù)，阻礙了癌癥DNA甲基化生物標(biāo)志物在臨床上的應(yīng)用。整合癌癥相關(guān)WGBS數(shù)據(jù)為精確識(shí)別這些生物標(biāo)志物提供了一種很有前途的方法。隨著癌癥DNA甲基化生物標(biāo)志物研究的快速進(jìn)展，癌癥相關(guān)WGBS數(shù)據(jù)的可用性急劇增加。然而，目前沒有專門的資源癌癥DNA甲基化生物標(biāo)志物WGBS數(shù)據(jù)。
       MethMarkerDB，一個(gè)用戶友好、可訪問的數(shù)據(jù)庫，集成了724個(gè)DNA甲基化生物標(biāo)志物基因，并包含來自PubMed上發(fā)表的文章和廣泛的全基因組DNA甲基化測(cè)序（WGBS）數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫提取了這些生物標(biāo)志物基因中真正具有功能的差異甲基化區(qū)域（DMR），并進(jìn)行了精細(xì)的分析、整合和呈現(xiàn)。它包含了基于文獻(xiàn)的基因標(biāo)記、DMR標(biāo)記以及診斷和預(yù)后評(píng)估功能，為研究人員提供了強(qiáng)大的工具，以更好地了解和利用癌癥DNA甲基化生物標(biāo)志物。

• Search

       已搜索基因?yàn)槔x擇癌癥類型并輸入基因名稱，點(diǎn)擊”Search”進(jìn)行搜索即可：

       結(jié)果界面顯示基因的詳細(xì)信息、甲基化信息、相關(guān)文獻(xiàn)等：

• Analysis

       以Pan-cancer DMR分析為例，輸入基因名、選擇篩選標(biāo)準(zhǔn)，點(diǎn)擊“Search”即可：

       結(jié)果頁面展示包含該基因的多種癌癥類型：