腫瘤上皮細(xì)胞與腫瘤微環(huán)境(TME)之間的雙向信號轉(zhuǎn)導(dǎo)對腫瘤的發(fā)生發(fā)展具有重要意義。本研究表明,Lin28b/let-7通路是調(diào)節(jié)腫瘤上皮中Wnt5a表達(dá)不可或缺的途徑,Wnt5a可以在癌相關(guān)成纖維細(xì)胞(CAFs)中分泌并上調(diào)Lin28b。此外,作者證明CAFs中的Lin28b通過誘導(dǎo)細(xì)胞因子PCSK9的產(chǎn)生來促進(jìn)PDAC的生長。使用PDAC原位小鼠模型,作者發(fā)現(xiàn)CAFs中Lin28b的缺失降低了腫瘤重量,突出Lin28b在PDAC基質(zhì)中的重要性。因此,作者研究表明,Lin28b-Wnt5a軸在胰腺腫瘤上皮細(xì)胞和TME之間的雙向串?dāng)_中起關(guān)鍵作用,并導(dǎo)致促腫瘤發(fā)生的環(huán)境。本文于2023年10月發(fā)表于《Nature Communication》,IF:16.6,Q1。
技術(shù)路線
主要實驗結(jié)果
1、Lin28b可在PDAC的CAFs中高表達(dá)
既往研究表明,LIN28B可促進(jìn)PDAC細(xì)胞的生長,且LIN28B水平升高與PDAC患者預(yù)后不良相關(guān)。為進(jìn)一步探討LIN28B在PDAC中的功能,作者對人PDAC組織微陣列(TMAs)進(jìn)行免疫組化染色。作者發(fā)現(xiàn)80個PDAC樣本中有23個(28.75%)在腫瘤上皮細(xì)胞中表達(dá)高水平的LIN28B。值得注意的是,LIN28B的表達(dá)與晚期腫瘤分級和不良預(yù)后相關(guān)(圖1a-c)。同時,作者觀察到一個有趣的現(xiàn)象,即大多數(shù)LIN28Bhigh樣本(23個樣本中的22個)在基質(zhì)中也表現(xiàn)出了LIN28B的高表達(dá)(圖1d),這促使作者進(jìn)一步探索LIN28B在PDAC基質(zhì)中的表達(dá)譜。以α-SMA表達(dá)為特征的癌相關(guān)成纖維細(xì)胞(CAFs)被認(rèn)為是PDAC的主要基質(zhì)成分。因此,作者在TMAs上對α-SMA進(jìn)行免疫熒光染色,觀察到LIN28B和α-SMA在LIN28Bhigh樣品中的共定位(圖1e),表明LIN28B在CAFs中的表達(dá)與其在腫瘤中的表達(dá)狀態(tài)高度相關(guān)。接下來,作者試圖在PDAC小鼠模型中驗證作者的發(fā)現(xiàn)。原代小鼠PDAC系14837T、14838T和15376T分別從基因工程C57BL/6小鼠(p48-Cre;tetO_LSL KrasG12D;ROSA_rtTA;p53L/+)中分離得到。作者發(fā)現(xiàn)Lin28b在15376T中高表達(dá),而在14837T和14838T中不表達(dá)(圖1f, g)。接下來,作者將14837T、14838T和15376T植入小鼠胰腺,發(fā)現(xiàn)15376T的原位模型在腫瘤和間質(zhì)中都表達(dá)了高水平的Lin28b,而14837T和14838T腫瘤僅顯示背景水平的Lin28b染色(圖1h, j)。這些結(jié)果表明,Lin28b可以在CAFs中表達(dá),盡管Lin28b通常被認(rèn)為在胚胎組織或癌癥組織中高度表達(dá)。
圖1 Lin28b可在PDAC的CAFs中高表達(dá)
2、在條件培養(yǎng)基中誘導(dǎo)Lin28b在腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)
接下來,作者從原位腫瘤中分離出小鼠CAF細(xì)胞系(mCAFs,分別命名為14837CAFs、14838CAFs和15376CAFs)。然而,作者發(fā)現(xiàn)在這些體外培養(yǎng)的細(xì)胞系中幾乎檢測不到Lin28b,這與免疫熒光數(shù)據(jù)不一致(圖2a,b)。作者懷疑PDAC細(xì)胞可能在維持基質(zhì)Lin28b表達(dá)方面發(fā)揮作用。因此,mCAFs與小鼠PDAC系共培養(yǎng)以模擬體內(nèi)環(huán)境。有趣的是,Lin28b可以在與15376T共培養(yǎng)的CAFs中被誘導(dǎo),而非與14837T或14838T,這表明Lin28b在CAFs中的表達(dá)與其在腫瘤中的表達(dá)狀態(tài)有關(guān)(圖2a, b)。為了進(jìn)一步證實作者的假設(shè),作者將14837CAFs直接與15376T或14837T共培養(yǎng)6天,然后通過流式細(xì)胞術(shù)(FACS)進(jìn)行分類(圖2c)。作者發(fā)現(xiàn),當(dāng)14837CAFs與15376T共培養(yǎng)時,Lin28b的表達(dá)增加,而與14837T共培養(yǎng)時,Lin28b的表達(dá)沒有增加(圖2d)。此外,作者從15376T開始用條件培養(yǎng)基(CM)處理CAFs 6天,也發(fā)現(xiàn)15376T-CM逐漸上調(diào)了Lin28b的表達(dá)(圖2e-j)。此外,15376T-CM在15376T中去除Lin28b后,其增加CAFs中Lin28b表達(dá)的能力被取消(圖2k, l)。接下來,作者試圖在人類PDAC中驗證作者的發(fā)現(xiàn)。作者測量了LIN28B在人PDAC細(xì)胞系中的表達(dá),發(fā)現(xiàn)LIN28B在PANC-1和PANC03.27中高表達(dá),而在ASPC-1、Mia Paca-2、PaTu8988T和PaTu8988S中不表達(dá)(圖2m, n)。此外,作者從2例患者中分離出人PDAC細(xì)胞系,發(fā)現(xiàn)LIN28B在hPDAC1#中高表達(dá),而在hPDAC2#中不表達(dá)(圖2m, n)。在人PDAC中也發(fā)現(xiàn)了類似的數(shù)據(jù),如PANC-1,PANC03.27和hPDAC1#中的CM以LIN28B依賴的方式誘導(dǎo)人CAFs (hCAFs)中LIN28B的表達(dá)(圖2p - r),證實腫瘤上皮中LIN28B的缺失導(dǎo)致人和小鼠PDAC中CAFs中LIN28B的失活。為了在體內(nèi)驗證這一現(xiàn)象,作者將15376T或Lin28b-KO 15376T注射到小鼠胰腺中。免疫熒光染色顯示,在原位模型中,在腫瘤中沉默Lin28b可降低間質(zhì)Lin28b的表達(dá)(圖2s)。綜上所述,這些數(shù)據(jù)表明具有高水平Lin28b (Lin28bhigh)的腫瘤細(xì)胞可以上調(diào)間質(zhì)Lin28b的表達(dá)。
圖2 在條件培養(yǎng)基中誘導(dǎo)Lin28b在腫瘤細(xì)胞中的表達(dá)
3、Lin28bhigh的PDAC細(xì)胞分泌Wnt5a誘導(dǎo)CAFs中Lin28b的表達(dá)
然后,作者利用15376T、Lin28b- KO、15376T和14837T的RNA測序(RNA-seq)進(jìn)一步了解腫瘤細(xì)胞上調(diào)基質(zhì)Lin28b表達(dá)的機(jī)制。與Lin28b-KO 15376T和14837T相比,15376T中發(fā)現(xiàn)了66個上調(diào)基因(圖3a)。在這些基因中,作者注意到兩個可溶性Wnts (Wnt配體),包括Wnt5a和Wnt10a,在15376T(圖3 b, c)和PANC-1(圖3 d, e)中上調(diào)。此外,Wnt5a和Wnt10a被酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)在Lin28bhigh腫瘤但不是Lin28blow腫瘤的CM檢測到(圖3 f, g)。然后,作者試圖確認(rèn)Wnt5a或Wnt10a在驅(qū)動CAFs中Lin28b表達(dá)中的作用。如圖3h - 1所示,在腫瘤中敲除Wnt5a而不敲除Wnt10a可抑制腫瘤細(xì)胞誘導(dǎo)CAFs中Lin28b表達(dá)的能力,突出了Wnt5a在誘導(dǎo)Lin28b中的作用。此外,作者發(fā)現(xiàn)重組-Wnt5a上調(diào)了CAFs中Lin28b的表達(dá)(圖3m-q),而用中和抗體阻斷Wnt5a信號通路會減弱15376T- CM上調(diào)CAFs中Lin28b表達(dá)的能力(圖3r, s)。接下來,作者通過將15376T和Wnt5a- KO 15376T注射到小鼠胰腺來檢測Wnt5a在體內(nèi)的作用。免疫熒光染色顯示,在原位模型中,敲除腫瘤中的Wnt5a可降低間質(zhì)Lin28b的表達(dá)(圖3t)。
圖3 Lin28bhigh的PDAC細(xì)胞分泌Wnt5a誘導(dǎo)CAFs中Lin28b的表達(dá)
4、Wnt5a-Fzd4-β-catenin通路在Lin28b誘導(dǎo)中起關(guān)鍵作用
由于作者提供Wnt5a導(dǎo)致PDAC基質(zhì)中Lin28b活化的證據(jù),作者接下來研究Wnt5a誘導(dǎo)Lin28b表達(dá)的機(jī)制。眾所周知,Wnt信號通路通常分為兩大類,β-catenin依賴的典型通路和β-catenin獨(dú)立的非典型通路。Wnt5a傳統(tǒng)上被認(rèn)為是非標(biāo)準(zhǔn)WNT。然而,除了激活非典型信號通路外,據(jù)報道Wnt5a在Fzd4受體的存在下也能激活典型信號通路。因此,作者檢測了Fzd4的水平,發(fā)現(xiàn)Lin28b只能在Wnt5a和Fzd4高表達(dá)的腫瘤細(xì)胞系中檢測到(圖4a, b),這表明完整的Wnt5a-Fzd4通路是激活PDAC中Lin28b的必要條件。接下來,作者在CAFs中敲除Fzd4,發(fā)現(xiàn)15376T-CM和recombin- wnt5a都不能誘導(dǎo)Fzd4- KO CAFs中Lin28b的表達(dá)(圖4c, d)。為了進(jìn)一步證實Fzd4的重要性,并考慮到CAF的異質(zhì)性,作者使用FACS從KPC (KrasLSL-G12D+;Trp53R172H/+;Pdx1-Cre)小鼠中分離出CAFs,然后使用Fzd4抗體將CAFs分離為Fzd4陽性和Fzd4陰性群體(圖4e)。同樣,Lin28b也只能在fzd4陽性的CAFs中被誘導(dǎo)表達(dá)(圖4f)。作者還發(fā)現(xiàn),當(dāng)誘導(dǎo)Lin28b表達(dá)時,β-catenin (Wnt通路中的細(xì)胞內(nèi)信號換能器)的水平在CAFs中上調(diào)(圖4g - i)。此外,Lin28bhigh腫瘤CM和r-Wnt5a均可誘導(dǎo)CAFs中Lin28b啟動子中β-catenin的富集(圖j - l)。為了進(jìn)一步檢測Wnt/β-catenin信號通路的激活情況,作者將T細(xì)胞因子/淋巴細(xì)胞增強(qiáng)因子結(jié)合因子(TCF/LEF)熒光素酶報告因子轉(zhuǎn)染到CAFs中,發(fā)現(xiàn)Lin28bhigh腫瘤- CM和r-Wnt5a均能促進(jìn)熒光素酶活性(圖4m),提示W(wǎng)nt/β-catenin信號通路被激活。此外,在CAFs中抑制β-catenin可減弱來自Lin28bhigh腫瘤的CM誘導(dǎo)的Lin28b的表達(dá)(圖4n-s)。這些數(shù)據(jù)提示W(wǎng)nt5a-Fzd4-β-catenin通路在CAFs中刺激Lin28b表達(dá)起關(guān)鍵作用。
圖4 Wnt5a-Fzd4-β-catenin通路在Lin28b誘導(dǎo)中起關(guān)鍵作用
5、Lin28b陽性的CAFs促進(jìn)胰腺癌的生長
接下來,作者試圖探索Lin28b在CAFs中的作用。眾所周知,腫瘤對葡萄糖的快速消耗會導(dǎo)致葡萄糖缺乏的微環(huán)境。同時,在營養(yǎng)不良的TME中,CAFs可以分泌各種生長因子和代謝物,維持癌細(xì)胞的增殖。毫不奇怪,作者發(fā)現(xiàn)在葡萄糖限制條件下(2 mM葡萄糖),CAFs對PDAC增殖有積極作用,這再現(xiàn)了體內(nèi)嚴(yán)峻的腫瘤微環(huán)境(圖5a)。相比之下,在低糖處理下,Lin28b-KO CAFs不能挽救PDAC的增殖(圖5b)。然后,作者發(fā)現(xiàn)表達(dá)Lin28b的CAFs的CM能夠在葡萄糖限制條件下挽救腫瘤生長(圖5c, d)。接下來,將腫瘤細(xì)胞與不同類型的CAFs共同注射到小鼠胰腺中。15376T與Lin28b-KO 15376CAFs共注射,而不是與WT 15376CAFs共注射,可以減緩腫瘤在體內(nèi)的生長(圖5e-g)。此外,當(dāng)與表達(dá)WT -Lin28b的CAFs共注射時,腫瘤(14837T)的生長顯著增加,而當(dāng)PDAC細(xì)胞與14837CAFs或15376CAFs共注射時,腫瘤(14837T)的生長明顯減弱(圖5h, i)。這些發(fā)現(xiàn)表明,間質(zhì)Lin28b表達(dá)可能在PDAC生長中起關(guān)鍵作用。此外,由于作者的數(shù)據(jù)表明Wnt5a-Fzd4通路對于Lin28b的激活至關(guān)重要(圖4c, d, f),作者也測試了Fzd4在腫瘤生長中的作用。如圖5j-n所示,fzd4陽性的CAFs在體外和體內(nèi)均能挽救腫瘤的生長,說明fzd4介導(dǎo)的CAFs中Lin28b的表達(dá)促進(jìn)了PDAC的生長。
為了進(jìn)一步證實Lin28b在CAFs中的作用,作者通過將Lin28bfl/fl小鼠與FSP1-Cre小鼠雜交,建立了成纖維細(xì)胞特異性條件Lin28b敲除模型。然后將15376T植入野生型(WT)小鼠和FSP-Cre;Lin28bfl/fl小鼠胰腺,對原位腫瘤進(jìn)行免疫熒光染色。如圖5o所示,與WT小鼠相比,FSP-Cre;Lin28bfl/fl小鼠中基質(zhì)Lin28b顯著下調(diào)。在PDAC原位模型中,與WT小鼠相比,FSP-Cre;Lin28bfl/fl小鼠中生長的腫瘤明顯更?。▓D5p)。此外,在FSP-Cre;Lin28bfl/fl小鼠中,Ki67-陽性細(xì)胞群顯著減少(圖5q, r),表明lin28b陽性CAFs促進(jìn)了體內(nèi)PDAC的生長。
圖5 Lin28b陽性的CAFs促進(jìn)胰腺癌的生長
6、CAFs分泌Pcsk9促進(jìn)PDAC生長
為了進(jìn)一步研究Lin28b陽性CAFs促進(jìn)PDAC生長的機(jī)制,作者將CAFs- CM進(jìn)行了三次凍解凍循環(huán)(- 80°C, 60°C)或加熱(100°C, 15分鐘),發(fā)現(xiàn)增加PDAC增殖的能力被取消(圖6a)。此外,通過3-kDa切斷柱過濾CAFs-CM,在CAFs-CM的>3-kDa部分保留促瘤活性(圖6b)。因此,作者認(rèn)為由CAFs分泌的細(xì)胞因子,而不是代謝物,在腫瘤生長中起作用。接下來,作者使用來自15376CAFs或Lin28b- KO 15376CAFs的CM進(jìn)行了定量分泌組學(xué)分析,以鑒定Lin28b陽性CAFs分泌的細(xì)胞因子(圖6c)。在Lin28b- KO 15376CAFs中下調(diào)的分泌蛋白中,TargetScan (https://www.targetscan.org)預(yù)測了五個基因(Clu, Cxcl5, FN, PGRN和Pcsk9)作為Lin28b/let-7的直接靶點(diǎn)(圖6c)。為了進(jìn)一步驗證這些基因是否受到Lin28b/let-7通路的調(diào)控,作者構(gòu)建了一個不能抑制let-7的小鼠Lin28b突變質(zhì)粒(圖6d、e)。突變體Lin28b包含5個突變(W34A、F43A、F61A、H159A和H181A),分布在冷休克結(jié)構(gòu)域(CSD)和CysCysHisCys (CCHC)鋅指RNA結(jié)合基元(人W36、F45、F63、H137和H159)。接下來,CRISPR/ Cas9抗性野生型Lin28b (flag-Lin28b- WT (r))和突變型Lin28b (flag-Lin28b- MU (r))在Lin28b缺失的細(xì)胞中過表達(dá),作者發(fā)現(xiàn)flag-Lin28b- WT(r),而不是flag-Lin28b- MU(r),增加了Clu、Cxcl5、PGRN和Pcsk9的水平(圖6f-j)。此外,CAFs- CM中的PGRN和Pcsk9水平遠(yuǎn)高于腫瘤- CM,因此作者重點(diǎn)研究了PGRN和Pcsk9在CAFs中的功能(圖6i, j)。用重組蛋白或中和抗體處理PDAC細(xì)胞發(fā)現(xiàn),在限糖條件下,Pcsk9而不是PGRN增加了PDAC的增殖,這表明Pcsk9在調(diào)節(jié)腫瘤生長方面的作用(圖6k, l)。為了進(jìn)一步驗證Pcsk9的功能,作者敲除了CAFs中的Pcsk9(圖6m)。值得注意的是,Pcsk9-KO CAFs不能在葡萄糖限制的培養(yǎng)基中挽救腫瘤生長(圖6n)。與體外實驗數(shù)據(jù)一致,PDAC細(xì)胞與Pcsk9-KO CAFs共注射時,原位腫瘤明顯小于野生型CAFs(圖6o - s)。作者還檢測了Pcsk9抑制劑alirocumab在原位模型中的療效,發(fā)現(xiàn)alirocumab可顯著抑制腫瘤生長(圖6t)??傊@些數(shù)據(jù)表明lin28b陽性CAFs分泌的Pcsk9促進(jìn)PDAC的生長。
圖6 CAFs分泌Pcsk9促進(jìn)PDAC生長
7、Pcsk9是Lin28b/let-7的直接靶點(diǎn)
接下來,作者試圖確定Pcsk9是否是Lin28b/let-7的直接靶點(diǎn)。表達(dá)Lin28b的CAFs-CM或Fzd4陽性的CAFs-CM中的Pcsk9水平遠(yuǎn)高于不表達(dá)Lin28b或Fzd4陰性的CAFs的CM(圖7a-h)。作者發(fā)現(xiàn)flag-Lin28b-WT(r),而不是flag-Lin28b-MU(r),增加了被Lin28b敲除抑制的Pcsk9蛋白水平(圖7i)。此外,let-7a agomir降低Pcsk9, let-7 sponge增加Pcsk9,表明Pcsk9能夠受到Lin28b/let-7通路的調(diào)控(圖7j)。然后,雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烇@示,let-7a agomir抑制了Pcsk9 mRNA野生型3’-UTR驅(qū)動的熒光素酶,但不影響突變型3’-UTR驅(qū)動的熒光素酶(圖7k, 1),表明Pcsk9是let-7a miRNAs的直接靶點(diǎn)。miRNAs主要通過促進(jìn)mRNA降解或抑制蛋白質(zhì)翻譯來調(diào)節(jié)基因表達(dá)。為了進(jìn)一步探討Lin28b/let-7是否影響Pcsk9 mRNA的穩(wěn)定性,作者使用Actinomycin D阻斷轉(zhuǎn)錄,然后檢測mRNA水平。Lin28b敲除不影響Pcsk9 mRNA的降解,這表明Lin28b/let-7不調(diào)節(jié)Pcsk9 mRNA的降解(圖7m, n)。因此,作者研究Lin28b/let-7是否通過調(diào)節(jié)翻譯影響Pcsk9 蛋白水平。值得注意的是,Lin28b缺失減少了Pcsk9 mRNA在多體部分的存在,但在非翻譯核糖體部分增加了Pcsk9 mRNA的存在(圖7o)。此外,flag-Lin28b-WT(r)而不是flag-Lin28b-MU(r)誘導(dǎo)Pcsk9 mRNA向更重的多聚體部分轉(zhuǎn)移(圖7p)。這些結(jié)果表明,Lin28b/let-7調(diào)控的是Pcsk9的翻譯,而不是mRNA的穩(wěn)定性。此外,IHC染色顯示,與野生型小鼠相比,FSP-Cre;Lin28bfl/fl小鼠的Pcsk9表達(dá)顯著降低,表明體內(nèi)Lin28b調(diào)節(jié)了CAFs中Pcsk9的表達(dá)(圖7q, r)。綜上所述,作者研究結(jié)果證實Pcsk9是CAFs中Lin28b/let-7的直接靶點(diǎn)。
圖7 Pcsk9是Lin28b/let-7的直接靶點(diǎn)
結(jié)論
在這項研究中,作者發(fā)現(xiàn)胰腺癌細(xì)胞中Wnt5a和Lin28b之間存在正反饋回路(圖8)。研究表明Wnt5a可以作為腫瘤上皮細(xì)胞和CAFs之間的信號轉(zhuǎn)換器,Lin28b-Wnt5a軸在胰腺腫瘤上皮細(xì)胞和TME之間的雙向串?dāng)_中起關(guān)鍵作用,并導(dǎo)致促腫瘤發(fā)生的環(huán)境。
圖8 PDAC中Wnt5a和Lin28b之間的正反饋回路
實驗方法
轉(zhuǎn)基因小鼠細(xì)胞系;小鼠模型;細(xì)胞培養(yǎng);直接接觸共培養(yǎng)和FACS;KPC CAFs 的流式細(xì)胞術(shù)及分選;間接共培養(yǎng)實驗(Transwell);條件培養(yǎng)基(CM);異種移植;抗體和試劑;實時熒光定量PCR(qPCR)基因表達(dá)分析;基因組DNA分離及基因型鑒定;Western Blotting;ELISA;CRISPR/Cas9 KO細(xì)胞系的生成;lentiviral-shRNA干擾;超表達(dá)質(zhì)粒;定量分泌組樣品制備及LC-MS/MS分析;分泌數(shù)據(jù)分析;RNA-seq分析;全外顯子組測序(WES)分析;miRNA靶基因的預(yù)測;染色質(zhì)免疫共沉淀(CHIP);質(zhì)粒構(gòu)建及熒光素酶測定;mRNA穩(wěn)定性分析;核糖體的蔗糖梯度分析;免疫組化染色;免疫熒光分析;馬森三色染色法。
參考文獻(xiàn):
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