ncEP:非編碼RNA編碼肽數(shù)據(jù)庫

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2024-07-23
ncEP是一個(gè)用于收集ncRNA編碼的蛋白質(zhì)或肽的數(shù)據(jù)庫,這些蛋白質(zhì)或肽已通過發(fā)表論文中的低通量實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了驗(yàn)證......

 

        越來越多的證據(jù)表明,非編碼RNAncRNA),如lncRNA、circRNApri-miRNA,可以編碼蛋白質(zhì)或肽。ncEP是一個(gè)用于收集ncRNA編碼的蛋白質(zhì)或肽的數(shù)據(jù)庫,這些蛋白質(zhì)或肽已通過發(fā)表論文中的低通量實(shí)驗(yàn)進(jìn)行了驗(yàn)證。ncEP包含由ncRNA編碼的蛋白質(zhì)或肽的特征,如名稱、序列、物種、基因組位置、組織或細(xì)胞系、實(shí)驗(yàn)方法、數(shù)據(jù)源和其他詳細(xì)信息。http://www.jianglab.cn/ncEP/index.html

 


 

Search

        用戶可以使用ncRNA名稱、ncRNA編碼的蛋白/肽名稱、染色體位置進(jìn)行搜索。

 


 

        以ncRNA名稱為例,選擇感興趣的ncRNA點(diǎn)擊“Search:

 


 

        結(jié)果頁面展示編碼蛋白/肽的長度、文獻(xiàn)來源等信息:

 


 

Browse

        用戶可以通過選擇感興趣的物種,瀏覽特定物種中已發(fā)表的ncRNA編碼蛋白/肽。

 


 

        以human為例,點(diǎn)擊“more”可以瀏覽具體信息:




Genome Browser

        選擇感興趣的物種(人/小鼠/果蠅)后,選擇特定的蛋白/肽,可以瀏覽蛋白/肽在基因組中的信息: