急性骨髓性白血病患者的單細(xì)胞的大規(guī)模平行數(shù)字轉(zhuǎn)錄組分析
急性骨髓性白血病患者的單細(xì)胞的大規(guī)模平行數(shù)字轉(zhuǎn)錄組分析
DOI: 10.1038/ncomms14049
參考文獻(xiàn)：Zheng G X Y, Terry J M, Belgrader P, et al. Massively parallel digital transcriptional profiling of single cells[J]. bioRxiv, 2016: 065912.
基于GemCode技術(shù)和液滴方法，F(xiàn)red Hutch團(tuán)隊(duì)和10X Genomics 利用微流體平臺(tái)，提高單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的效率。這種技術(shù)將帶有條形碼、索引分子、引物和其他凝膠珠與單細(xì)胞混合，油滴封閉6分鐘，約50%的細(xì)胞捕獲效率。每個(gè)液滴內(nèi)發(fā)生逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)，以便于獲得測(cè)序所需的帶有條形碼的cDNA, 能夠計(jì)算每個(gè)樣品中所有捕獲單細(xì)胞的mRNA表達(dá)。
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的研究有利于研究人員了解復(fù)雜的生物系統(tǒng)。10X Genomics和Fred Hutchinson癌癥研究中心的研究人員選取了29例樣本，檢測(cè)了250000個(gè)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組。利用細(xì)胞系和合成RNA檢測(cè)單細(xì)胞測(cè)序系統(tǒng)的敏感性和發(fā)現(xiàn)稀有群體的能力；利用68000個(gè)外周血單核細(xì)胞系統(tǒng)區(qū)分了免疫群體；結(jié)合單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的序列突變，檢測(cè)器官移植病人的骨髓單核細(xì)胞在宿主與供體細(xì)胞的嵌合情況。
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