LncRNA助力結直腸癌研究
導語：結直腸癌（CRC）很恐怖，科研工作者責任重大。小小lncRNA顯神通，助力CRC研究義不容辭。今天，小編就帶大家一睹其風采。
思維脈絡：
結果：
1. 結直腸組織特異性lncRNA SATB2-AS1在CRC組織中下調(diào)
SATB2-AS1在結腸癌組織和細胞中均顯著降低。分析ASTB2-AS1表達與CRC臨床病理的關系，SATB2-AS1的表達與腫瘤浸潤深度、淋巴結轉移、TNM階段相關，生存分析顯示較低的SATB2-AS1水平與不良的整體生存和不良的無復發(fā)生存相關。
2.SATB2-AS1抑制CRC轉移，其表達與腫瘤內(nèi)免疫細胞豐度相關
使用CRC轉錄組數(shù)據(jù)進行基因富集分析顯示HALLMARK_EPITHELIAL_MESENCHYMAL_TRANSITION，HALLMARK_INFLAMMATORY_RESPONSE，HALLMARK_COMPLEMENT，HALLMARK_INTERFERON_GAMMA _RESPONSE和HALLMARK_INTERFERON_ALPHA_RESPONSE的基因簽名富集在SATB2-AS1低表達患者中。敲低SATB2-AS1增加CRC細胞的遷移和侵襲能力。小鼠肺轉移模型顯示沉默SATB2-AS1促進了肺轉移。沉默SATB2-AS1降低E-鈣粘蛋白表達和增加Vimentin表達，轉移相關蛋白MMP9上調(diào)表達。SATB2-AS1的表達與多種免疫反應相關?；诮M織中免疫細胞浸潤的數(shù)量，將CRC樣本分為“高滲透”組和“低滲透”組。發(fā)現(xiàn) “高滲透”組中大多數(shù)樣品SATB2-AS1的表達低于所有樣本的中等水平，樣本分布具有統(tǒng)計學意義。發(fā)現(xiàn)TH1型趨化因子CXCL9和CXCL10SATB2-AS1敲低的CRC細胞表達升高。
3.SATB2-AS1通過調(diào)節(jié)SATB2發(fā)揮其生物學作用
沉默SATB2-AS1會明顯減少同源基因SATB2的蛋白和RNA水平。CRC組織SATB2表達顯著減少，生存分析表明SATB2低表達與較短的總體生存率和無復發(fā)生存率密切相關。相關性分析表明CRC組織中SATB2-AS1表達與SATB2顯著正相關。SATB2過表達抑制癌細胞的遷移侵襲能力， SATB2過表達細胞中的SATB2-AS1敲除可部分減輕抑制。小鼠接種過表達SATB2的HCT-116細胞較長總體存活時間、較低的轉移率和肺部轉移灶較少，沉默SATB2-AS1可部分恢復被SATB2過表達抑制的轉移能力。SATB2可部分削弱過表達SATB2的CRC細胞中E-cadherin的增加水平，Vimentin和MMP-9的減少可通過SATB2-AS1沉默部分挽救。SATB2-AS1表達低的患者顯示較低的SATB2和E-cadherin表達以及較高的Vimentin表達，SATB2-AS1表達水平與SATB2和E-cadherin呈正相關與Vimentin表達負相關。SATB2過表達抑制CXCL9和CXCL10在CRC細胞中的表達，SATB2-AS1敲低可部分緩解由SATB2引起的CXCL9和CXCL10的降低。
4.SATB2-AS1直接綁定到WDR5和GADD45A，CRC中SATB2的低表達是由于啟動子區(qū)的高DNA甲基化和組蛋白H3K4me3損失引起的
SATB2-AS1主要在細胞核中表達，用生物素化的SATB2-AS1拉出WDR5（組蛋白H3K4甲基轉移酶復合物）和DNA去甲基化的調(diào)節(jié)劑GADD45A，構建SATB2-AS1的五個片段驗證WDR5和GADD45A的SATB2-AS1相互作用區(qū)域，結果顯示SATB2-AS1的3'片段介導了其與WDR5和GADD45A的相互作用。CRC組織R3和R4區(qū)域的DNA甲基化程度更高，H3K4me3在SATB2啟動子中的富集在CRC細胞中顯著低于正常細胞。
5.SATB2-AS1通過募集WDR5和GADD45A蛋白調(diào)節(jié)SATB2啟動子的DNA去甲基化和H3K4me3富集
SATB2-AS1可以生理結合具有SATB2的啟動子序列，ChIP-PCR結果顯示HCT-116細胞（C1，C2，C3，C5，C8位點）和HCT-8細胞（C1，C2，C3，C6，C7，C8，C9位點）的SATB2啟動子區(qū)域中H3K4me3的富集水平在SATB2-AS1敲低后顯著下降。BSP實驗表明CRC細胞的SATB2啟動子區(qū)域中的DNA甲基化水平在敲低SATB2-AS1后顯著增加。上皮標志物E-cadherin也在WDR5-或GADD45A過表達CRC細胞中上調(diào)，它的上調(diào)可以SATB2-AS1沉默被廢除。Vimentin在WDR5或GADD45A過表達的CRC細胞表達降低，其減少可由SATB2-AS1沉默所挽救。
