代謝相關(guān)新microRNA——miR-378a

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2020-02-28
小非編碼RNA——microRNAs作為轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)節(jié)因子的發(fā)現(xiàn),為開發(fā)新的策略來對抗上述疾病打開了新的大門......

   代謝性疾病,如2型糖尿病或肥胖癥,是機(jī)體代謝途徑中斷的結(jié)果。小非編碼RNA——microRNAs(MiRNAs)——作為轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)節(jié)因子的發(fā)現(xiàn),為開發(fā)新的策略來對抗上述疾病打開了新的大門。miR-378a,miR-378a-3p和miR-378a-5p的兩條鏈在Ppargc1b基因中編碼,在如線粒體代謝和自噬等幾種代謝途徑的調(diào)節(jié)中起著積極的作用。最近的研究確認(rèn)miR-378a是能量和葡萄糖穩(wěn)態(tài)的重要調(diào)節(jié)因子,并強(qiáng)調(diào)它是改善代謝失調(diào)的潛在靶點(diǎn)。在綜述“miR?378a: a new emerging microRNA in metabolism”中,討論了miR-378a的已有知識(shí),并特別強(qiáng)調(diào)其在新陳代謝、線粒體和自噬中的生物學(xué)功能和作用機(jī)制。

說明: C:\Users\y505\Desktop\miR-378a a new emerging microRNA in metabolism\$`0%VDL`T}$LN[~9(LXCH[W.png


一、miR-37a對代謝的調(diào)節(jié)
1.miR-378a的起源和結(jié)構(gòu)

   過氧化物酶體增殖物激活受體-γ(PPARγ)協(xié)同激活因子-1β(PGC-1β)由基因Ppargc1b編碼并在其第一內(nèi)含子中嵌入miR-378家族的兩個(gè)成員(圖1)。

圖一:miR-378a在Ppargc1b中的基因組定位。MIR-378a位于Ppargc1b的第一內(nèi)含子中,其preRNA的加工產(chǎn)生了兩條鏈,miR-378a-5p和miR-378a-3p。miR-378a-3p:通常被識(shí)別為miR-378,曾被命名為miR-422b。miR-378a-5p:通常識(shí)別為miR-378*。miR-378a-3p和miR-378a-5p在線粒體豐富的組織中表達(dá),如骨骼肌、心臟、肝臟和棕色脂肪組織(BAT),且可能參與PGC-1β調(diào)控的代謝途徑,如葡萄糖和系統(tǒng)能量穩(wěn)態(tài)、脂肪酸氧化和線粒體代謝。此外,這些miRNAs還與癌癥代謝和組織分化有關(guān),例如,miR-378a通過抑制肌源性抑制因子MyoR誘導(dǎo)成肌細(xì)胞分化,對牛前脂肪細(xì)胞誘導(dǎo)分化,通過下調(diào)MAPK1誘導(dǎo)3T3-L1細(xì)胞分化,在棕色脂肪細(xì)胞分化過程中觀察到miR-378a-3p水平升高,與先前觀察到的PGC-1βmRNA水平在BAT分化和C2C12成肌細(xì)胞分化過程中升高的情況一致。

2. miR-378a在腫瘤發(fā)展中的作用
   瓦爾堡效應(yīng)是指在有氧條件下,癌細(xì)胞優(yōu)先選擇糖酵解而不是氧化磷酸化作為其主要的能量代謝途徑,其主要目的是通過將糖酵解中間體引導(dǎo)到生物合成途徑中來促進(jìn)癌細(xì)胞的增殖和生長。但癌細(xì)胞的新陳代謝是收多種因素調(diào)節(jié)的,如miRNAs。
   已有報(bào)道m(xù)iR-378a參與腫瘤代謝、腫瘤生長和血管生成。miR-378a-5p的過度表達(dá)導(dǎo)致雌激素相關(guān)受體γ(ERRγ)和轉(zhuǎn)錄因子GA結(jié)合蛋白α(GABA PA)的mRNA水平降低,揭示了內(nèi)含子miRNA直接參與其宿主基因伙伴的調(diào)節(jié)。MIR-378a-5p也被發(fā)現(xiàn)是乳腺癌細(xì)胞中瓦爾吧效應(yīng)的主要參與者。它的過度表達(dá)有利于糖酵解途徑,通過下調(diào)編碼三羧酸(TCA)循環(huán)的代謝物的代謝基因,ERRγ靶向,同時(shí)減少有氧呼吸。

3. miR-378a在代謝失調(diào)中的作用
   miR-378a-3p和miR-378a-5p參與了代謝紊亂的調(diào)控,被發(fā)現(xiàn)可干擾大量的細(xì)胞過程(表1)。
                                         表一 miR-378a的代謝和自噬相關(guān)靶點(diǎn)

   有研究報(bào)道,絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(SRPK1)的減少和增加都會(huì)通過激活A(yù)KT導(dǎo)致相同的致瘤表型,miR-378a對新陳代謝的調(diào)節(jié)也可能存在類似的機(jī)制。此外, miR-378a-3p在小鼠中的過表達(dá)導(dǎo)致骨骼肌無用循環(huán)的激活,同時(shí)改善脂肪組織中的脂解作用。進(jìn)一步的實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)Akt1是miR-378a-3p的主要靶標(biāo),被發(fā)現(xiàn)通過AKT1/FOXO1/PEPCK途徑激活PEP-磷酸烯醇式PEP無效循環(huán)(圖2A)。PEP可以直接還原為乳酸,而不是用于為無效循環(huán)提供燃料; miR-378a-3p過表達(dá)不影響乳酸水平或乳酸脫氫酶A(LDHA)轉(zhuǎn)錄本水平。

圖二 miR-378a-3p對代謝和線粒體途徑的調(diào)節(jié)。a miR-378a-3p在調(diào)節(jié)氧化和線粒體代謝中起著至關(guān)重要的作用,被發(fā)現(xiàn)能抑制胰島素途徑的重要元件PI3K和AKT1。此外,抑制AKT1刺激了骨骼肌中的Pyruvic Acid-PEP無效循環(huán)。此外,miR-378a-3p抑制了氧化代謝的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,如NRF-1和CRAT。b miR-378a-3p轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體的模型,在其中干擾線粒體基因的轉(zhuǎn)錄,如ATP6。另一項(xiàng)研究報(bào)道m(xù)iR-378a-3p靶向并能夠抑制H9c2心肌細(xì)胞中的LDHA。miR-378a-3p導(dǎo)致葡萄糖代謝中斷,導(dǎo)致骨骼肌的能量缺乏狀態(tài),這被證明是獨(dú)立于胰島素信號(hào)傳導(dǎo)的。

4. miR-378a在線粒體功能障礙中的新作用
   線粒體功能障礙是一些代謝性疾病的特征。miR-378a參與線粒體內(nèi)氧化代謝的調(diào)控,其抑制作用被證明改善線粒體的氧化能力并增加了耗氧量;miR-378a-3p針對核呼吸因子-1(NRF-1);miR-378a-3p在HFD喂養(yǎng)的小鼠肝臟中上調(diào),抑制NRF-1,導(dǎo)致肝臟骨質(zhì)疏松癥的惡化。miR-378a-3p的過度表達(dá)抑制Nrf1促進(jìn)脂質(zhì)積累和損害脂肪酸氧化,導(dǎo)致肝骨病的加重(圖2A)。此外,NRF-1和miR-378a-3p似乎參與了前饋環(huán),其中NRF-1轉(zhuǎn)錄抑制miRNA。miR-378a-3p還被報(bào)道是一種在HFD處理的小鼠肝臟中通過靶向其編碼基因Prkag2的亞基AMPKγ2的抑制劑。miR-378a-3p似乎在纖維化中具有雙重作用,它有利于肥胖小鼠的肝纖維化,而當(dāng)在有肝纖維化的動(dòng)物身上使用時(shí)則具有治療作用。
1)線粒體基因組的調(diào)節(jié)因子mitomiR?378a?3p
   成熟的miRNAs高度集中在細(xì)胞質(zhì)中,但它們在細(xì)胞核或線粒體等細(xì)胞器中亦有存在。有報(bào)道稱功能性miRNAs位于線粒體內(nèi),被命名為線粒體定位miRNAs(MitomiRs),并被證明在線粒體基因表達(dá)調(diào)控中具有積極作用。事實(shí)上,線粒體可以由能夠干擾線粒體DNA轉(zhuǎn)錄的mRNA的有絲分裂因子進(jìn)行內(nèi)部調(diào)節(jié)。miR-378a-3p被鑒定為mitomiR(mitomiR-378a-3p),并被發(fā)現(xiàn)干擾編碼ATP合成酶FO亞單位6的線粒體ATP6。
2)復(fù)合物I抑制劑調(diào)節(jié)miR - 378a的表達(dá)
   線粒體復(fù)合物I是組成電子傳遞鏈的主要復(fù)合物之一,使其成為干擾氧化磷酸化的合適靶標(biāo)。melbine是治療T2 DM的常用雙胍類藥物,可抑制肝臟糖異生,繼而導(dǎo)致肝臟葡萄糖生成減少。melbine通過特異性抑制呼吸鏈復(fù)合物I而發(fā)揮作用,導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)AMP/ATP比值升高,從而觸發(fā)AMPK及其相關(guān)信號(hào)通路的激活。isoquinoline生物堿小檗堿也被報(bào)道分別通過抑制復(fù)合物I和通過激活骨骼肌和肝臟中的SIRT1和SIRT3激活A(yù)MPKor來改善T2 DM的狀況。這兩種抗糖尿病化合物被證明參與了miRNAs的調(diào)節(jié)。使用鎖定核酸(LNA)技術(shù)的miRNA圖譜顯示,在MIHA和HepG2細(xì)胞中,小檗堿處理似乎誘導(dǎo)了miR-378a的表達(dá)。此外,有報(bào)道m(xù)elbine能夠提高miR-378a-3p的表達(dá)水平。miR-378a-3p被證明是通過靶向細(xì)胞周期依賴性激酶1(CDK1)并下調(diào)這一重要的細(xì)胞分裂因子而抑制肝癌細(xì)胞增殖的重要角色,進(jìn)而導(dǎo)致抑制腫瘤生長。這是一個(gè)值得注意的發(fā)現(xiàn),因?yàn)閙iR-378a-3p刺激肝糖異生基因的表達(dá),而melbine已知可以抑制肝糖異生。因此,這個(gè)問題需要進(jìn)一步闡明,以了解melbine是如何上調(diào)miR-378a-3p的,以及它在多大程度上參與了melbine的作用機(jī)制。

5. miR - 378a可調(diào)節(jié)內(nèi)分泌
   一些細(xì)胞外miRNAs存在于血漿和血清中,甚至在健康和患病個(gè)體中表達(dá)不同。這表明miRNAs作為內(nèi)分泌分子能夠調(diào)節(jié)遠(yuǎn)距離靶細(xì)胞的基因表達(dá),還可以作為疾病生物標(biāo)記物的潛在用途。一些研究已經(jīng)提供了證據(jù)支持細(xì)胞外miRNAs在癌癥、心血管疾病或代謝性疾病中的生物學(xué)功能。最近的研究報(bào)道,在生物體液中發(fā)現(xiàn)miR-378a和其他幾種miRNAs。例如,與1型糖尿病和中度DKD患者相比,miR-378a-5p在重度糖尿病腎病(DKD)患者的外周血液中上調(diào)。在未來,確定這些修飾是否是組織特異性的,或者它們是否是從循環(huán)中攝取miRNA并從組織中釋放的結(jié)果是至關(guān)重要的?,F(xiàn)有的研究主要集中在對某一疾病中大量的胞外miRNAs的評價(jià),而沒有對胞外miR-378a的生理功能進(jìn)行詳細(xì)的探討。因此,有關(guān)miR-378a內(nèi)分泌功能的一些重要問題仍需進(jìn)一步探討。

二、miR - 378a對程序性細(xì)胞死亡的調(diào)節(jié)作用
   細(xì)胞存在多種死亡機(jī)制:凋亡、自噬或壞死。近年來,已發(fā)現(xiàn)miRNAs與自噬相關(guān),可干擾宏觀自噬途徑不同階段的組分。miR-378a可以調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡和自噬,有報(bào)道稱轉(zhuǎn)染miR-378a-3p的缺氧H9c2細(xì)胞通過降低CASP3蛋白水平而抑制凋亡并提高細(xì)胞存活率,而miR-378a-3p抑制則加劇了凋亡。胰島素樣生長因子1受體(IGF1R)被鑒定為miR-378a-3p的直接靶標(biāo),抑制AKT信號(hào)傳導(dǎo),從而導(dǎo)致促凋亡蛋白的上調(diào),促進(jìn)細(xì)胞死亡。
   miR-378a在宏觀自噬中的作用亦已被驗(yàn)證。miR-378a-3p對于維持骨骼肌細(xì)胞凋亡和自噬等細(xì)胞死亡程序是重要的。miR-378a在禁食或饑餓應(yīng)激下上調(diào),并被炎癥抑制。miR-378a-3p通過抑制CASP9抑制凋亡,并通過靶向和抑制正常激活A(yù)KT的磷酸肌醇依賴性激酶-1(PDK1)來增強(qiáng)宏觀自噬。宏觀自噬可由三個(gè)與AKT相互作用的不同因子調(diào)節(jié):FOXO1,F(xiàn)OXO3和哺乳動(dòng)物靶標(biāo)雷帕霉素復(fù)合物1(MTORC1)。一方面,miR-378a-3p導(dǎo)致FOXO1和FOXO3的激活,正向調(diào)節(jié)宏觀自噬。另一方面,mTORC1因此被miRNA抑制,導(dǎo)致自噬誘導(dǎo)劑ULK1復(fù)合物的激活。此外,缺乏miR-378a-3p/miR-378a-5p的小鼠在腓腸肌中發(fā)現(xiàn)異常腫脹的線粒體堆積。評估線粒體功能以進(jìn)一步證實(shí)線粒體氧化代謝受到miR-378a缺失的負(fù)面影響是很有意義的。