9分SCI文章——tRF高通量測序

   近年來，非編碼RNA研究熱潮興起，隨著研究的不斷深入，非編碼RNA的高分文章要求也就越來越高。然而，近日一篇測序為主的非編碼RNA文章出現(xiàn)在了9分的雜志中。我們來看看是如何做到的吧：

   研究者的研究對象是非編碼RNA—tRF，一類相對來說少有研究的small RNA。研究者以tsRNA為切入點，發(fā)現(xiàn)在慢性淋巴細胞性白血?。–LL）中tsRNA ts-43、ts-44相對于正常B細胞中下調(diào)了3-5倍，這兩個tsRNA均來自pre-tRNA His，而 tRNA His的tRF-5片段也顯著下調(diào)。因此，研究者對CLL中成熟tRF表達水平進行了研究。
一、small RNA測序：研究侵襲性、惰性CLL中tsRNA
1.對測序數(shù)據(jù)進行分析，篩選出差異表達的tsRNA，結(jié)果如下圖所示：

2.q-PCR驗證tsRNA在臨床樣本中的表達

二、ts-43、ts-44前體tRF-5表達下調(diào)

三、根據(jù)small RNA測序數(shù)據(jù)，結(jié)合q-PCR分析成熟tRF表達情況
1.對測序數(shù)據(jù)進行分析：CLL tRF表達與正常B細胞的確存在差異

2.q-PCR在臨床樣本中進行驗證

   綜上，研究者得出結(jié)論：成熟的tRF可能在CLL中行使致癌/抑癌的功能。
   高通量測序、非編碼RNA的研究在如今的科研中已相對“尋?！?，但尋找一個相對較新的非編碼RNA分子（如tRF、snoRNA）仍有可能發(fā)高分文章。