9分SCI文章——tRF高通量測(cè)序

   近年來，非編碼RNA研究熱潮興起，隨著研究的不斷深入，非編碼RNA的高分文章要求也就越來越高。然而，近日一篇測(cè)序?yàn)橹鞯姆蔷幋aRNA文章出現(xiàn)在了9分的雜志中。我們來看看是如何做到的吧：

   研究者的研究對(duì)象是非編碼RNA—tRF，一類相對(duì)來說少有研究的small RNA。研究者以tsRNA為切入點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)在慢性淋巴細(xì)胞性白血?。–LL）中tsRNA ts-43、ts-44相對(duì)于正常B細(xì)胞中下調(diào)了3-5倍，這兩個(gè)tsRNA均來自pre-tRNA His，而 tRNA His的tRF-5片段也顯著下調(diào)。因此，研究者對(duì)CLL中成熟tRF表達(dá)水平進(jìn)行了研究。
一、small RNA測(cè)序：研究侵襲性、惰性CLL中tsRNA
1.對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，篩選出差異表達(dá)的tsRNA，結(jié)果如下圖所示：

2.q-PCR驗(yàn)證tsRNA在臨床樣本中的表達(dá)

二、ts-43、ts-44前體tRF-5表達(dá)下調(diào)

三、根據(jù)small RNA測(cè)序數(shù)據(jù)，結(jié)合q-PCR分析成熟tRF表達(dá)情況
1.對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行分析：CLL tRF表達(dá)與正常B細(xì)胞的確存在差異

2.q-PCR在臨床樣本中進(jìn)行驗(yàn)證

   綜上，研究者得出結(jié)論：成熟的tRF可能在CLL中行使致癌/抑癌的功能。
   高通量測(cè)序、非編碼RNA的研究在如今的科研中已相對(duì)“尋常”，但尋找一個(gè)相對(duì)較新的非編碼RNA分子（如tRF、snoRNA）仍有可能發(fā)高分文章。