LncRNA與周期蛋白抑制劑耐藥性

    雌激素受體陽性（ER +）乳腺癌約占所有乳腺癌的三分之二，并有持續(xù)晚期疾病復發(fā)的風險。細胞周期蛋白依賴性激酶4和6（CDK4 / 6）抑制劑在ER +乳腺癌中已顯示出顯著療效。但是，它們的作用仍然受到耐藥性的限制。今天這篇研究探討lncRNA在ER +乳腺癌中的作用，帶我們熟悉了解lncRNA的研究思路。

技術路線:

結 果:
1. ER +乳腺癌中LncRNA TROJAN高表達并預測差生存
    乳腺癌和正常人組織中TROJAN表達增高，數據庫顯示TROJAN與不良生存相關，TROJAN是獨立的預后因素。GO分析表明TROJAN相關基因中細胞周期相關基因的富集程度更高。TROJAN可能會通過細胞周期調節(jié)ER +乳腺癌的進展。

2. 抗TroJAN ASO治療使ER +乳腺癌對PD致敏
    使用ASO評估TROJAN在ER +乳腺癌中的治療潛力。ASO轉染的T47D細胞表現出降低的TROJAN表達以及降低的增殖能力，ASO和CDK4 / 6抑制劑（palbociclib，ribociclib和abemaciclib）可聯合抗癌功效比單獨抑制劑高。

3. TROJAN下調通過誘導G1 / S細胞周期停滯抑制ER +乳腺癌增殖
    細胞敲低TROJAN增殖潛能受損害, 過表達促進增殖。構建雌性裸鼠乳腺脂肪墊注射模型，以研究TROJAN對體內ER +乳腺癌增殖的影響。下調TROJAN顯著降低腫瘤體積，轉錄基因芯片分析TROJAN下調的細胞中與周期有關的生物過程發(fā)生顯著變化。TROJAN的下調導致G1期細胞增加，Cyclin E1 / 2降低，P21 / P27升高，增殖標記MKI67陽性少，在含PD的培養(yǎng)基中，PDR細胞的生長速度高于MCF7細胞和TROJAN敲低的PDR細胞。這些表明TROJAN通過調節(jié)G1 / S細胞周期促進ER +乳腺癌進展。

4. ER +乳腺癌中TROJAN與NKRF蛋白有關
    進一步探索TROJAN在ER +乳腺癌中的潛在的機制， 篩選出NKRF作為ER +乳腺癌中重要的TROJAN相互作用蛋白。TROJAN和NKRF在細胞核中共定位，異位表達全長FlagNKRF以及三個突變體：截短的R3H結構域（ΔNKRF-1）突變體，截短的R3H + G-patch域（ΔNKRF-2）突變體和NKRF N端（ΔNKRF-3）突變體。RIP分析表明刪除R3H + G域，但不能僅刪除R3H域，可取消TROJAN-NKRF相互作用。已知G-patch結構域具有RNA結合功能，因此TROJAN可以結合到NKRF的G-patch域。敲低NKRF 促進MCF7細胞的增殖，TROJAN敲低導致的增殖抑制可被另外的敲低NKRF減弱，這表明TROJAN敲低誘導的表型可能由NKRF部分營救。

5. TROJAN通過NKRF調節(jié)CDK2轉錄
    為研究TROJAN調控的下游靶標，分析TROJAN敲低的MCF7細胞微陣列數據，發(fā)現TROJAN敲低下調694個基因， 51個基因與TROJAN呈正相關，包括8個細胞周期有關基因。TROJAN敲低增加CDK2，NKRF敲低降低了蛋白的表達，TROJAN和NKRF的組合恢復了CDK2的表達。TROJAN敲除可抑制CDK2啟動子活性，被NKRF敲除激活。在異種移植模型， 在TROJAN敲除腫瘤中CDK2的表達降低。TROJAN敲低后NKRF的CDK2啟動子上結合能力顯著增加，TROJAN敲低MCF7細胞中過表達CDK2可部分恢復增殖抑制。這些表明TROJAN阻止NKRF在CDK2啟動子上的結合，并在轉錄水平調節(jié)CDK2的表達。

6. TROJAN與CDK2和MKI67正相關
    測定CDK2和增殖標記MKI67在ER +乳腺癌中的表達，發(fā)現TROJAN在mRNA和蛋白質水平上均與CDK2和MKI67正相關。

總 結：
    1. TROJAN-NKRF-CDK2的癌癥調控模式
    2. 抗TROJAN ASO與CDK4 / 6抑制劑聯合使用是有前途的聯合抗癌療法。