除了滋養(yǎng)肌膚,膠原蛋白還能促進(jìn)肝癌細(xì)胞的干細(xì)胞性

欄目:最新研究動(dòng)態(tài) 發(fā)布時(shí)間:2023-07-18
CD44 / DDR1 / YAP軸促進(jìn)癌細(xì)胞干性,提示DDR1 / YAP可能作為HCC新的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)……

   

實(shí)驗(yàn)方法HLF、Hep3B、SK-Hep1和HEK293 T細(xì)胞培養(yǎng),Sphere Assay,克隆形成實(shí)驗(yàn),流式細(xì)胞術(shù)分析,藥物抵抗和IC50,質(zhì)粒和慢病毒敲低小RNA,考馬斯亮藍(lán)染色,質(zhì)譜,反轉(zhuǎn)錄PCR,RT-qPCR,免疫印跡,免疫共沉淀(co-IP),谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶(GST)pull-down,免疫熒光,共聚焦顯微鏡成像,熒光素酶報(bào)告基因?qū)嶒?yàn),異種移植腫瘤形成,體內(nèi)藥物治療,RNA-Seq

 

腫瘤干細(xì)胞(cancer stem cells,CSCs)是一小群具有干性和多向分化潛能的腫瘤細(xì)胞,導(dǎo)致腫瘤進(jìn)展和治療抵抗。然而,CSCs在肝細(xì)胞癌(HCC)中的具體作用機(jī)制尚不清楚。作者發(fā)現(xiàn)在晚期HCC組織中,膠原蛋白表達(dá)上調(diào),與其受體DDR1的表達(dá)一致。因此,高膠原水平伴隨DDR1高表達(dá)與HCC患者的不良預(yù)后相關(guān)。膠原誘導(dǎo)的DDR1活化增強(qiáng)了肝癌細(xì)胞在體外和體內(nèi)的干性。機(jī)制上,DDR1與CD44相互作用,CD44作為共受體放大膠原誘導(dǎo)的DDR1信號(hào),膠原- DDR1信號(hào)通過(guò)促進(jìn)PP2AA募集到MST1來(lái)拮抗Hippo信號(hào),導(dǎo)致YAP活化過(guò)度。DDR1和YAP聯(lián)合抑制可協(xié)同抑制肝癌細(xì)胞的體外干性和體內(nèi)成瘤性?;赥2加權(quán)圖像的放射組學(xué)模型可以無(wú)創(chuàng)預(yù)測(cè)膠原表達(dá)。這些發(fā)現(xiàn)揭示了膠原- DDR1信號(hào)抑制Hippo信號(hào)的分子基礎(chǔ),并突出了CD44 / DDR1 / YAP軸在促進(jìn)癌細(xì)胞干性中的作用,提示DDR1和YAP可能作為HCC新的預(yù)后生物標(biāo)志物和治療靶點(diǎn)。

 

技術(shù)路線:


 

主要研究結(jié)果:

1、高膠原蛋白I和DDR1水平預(yù)示HCC患者預(yù)后不良

為分析HCC腫瘤內(nèi)膠原的類(lèi)型,作者對(duì)HCC組織進(jìn)行Picro-Sirius red染色。結(jié)果顯示,Ⅰ型膠原占膠原的比例最高(圖1A)。為探索Ⅰ型膠原在HCC中的臨床意義,作者檢測(cè)了123例具有相應(yīng)臨床病理特征的HCC組織芯片中Ⅰ型膠原的表達(dá)。與高分化HCC組織相比,Ⅰ型膠原在中分化HCC組織中高表達(dá),在低分化組織中表達(dá)最高(圖1B)。Kaplan-Meier分析顯示,腫瘤中Ⅰ型膠原蛋白高表達(dá)的患者比Ⅰ型膠原蛋白低表達(dá)的患者具有更低的總生存率和更高的復(fù)發(fā)率(圖1C)。Tumor sphere-forming assays顯示膠原I促進(jìn)HCC細(xì)胞干性的能力(圖1D)。

為檢測(cè)DDR1在HCC中的臨床意義,作者分析了相同組織芯片和TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中DDR1的水平。結(jié)果表明DDR1與Ⅰ型膠原呈正相關(guān)(圖1E-F)。根據(jù)Ⅰ型膠原和DDR1表達(dá)情況,將患者分為三組Col1+DDR1+(n?=?54)、Ⅰ型膠原/DDR1雙高表達(dá);Col1+DDR1-或Col1-DDR1+(n?=?33),Ⅰ型膠原或DDR1單高表達(dá);Col1-DDR1-(n?=?36),Ⅰ型膠原/DDR1雙低表達(dá)。與其他組相比,Col1+DDR1+組的總生存時(shí)間和無(wú)病生存時(shí)間最短(圖1G)??傊?,臨床樣本中Ⅰ型膠原和DDR1之間的關(guān)系表明,在HCC患者中,Ⅰ型膠原和DDR1的協(xié)同作用導(dǎo)致了較差的臨床結(jié)果,可能在HCC的發(fā)生和發(fā)展中起著重要作用。


圖1 I型膠原和DDR1在臨床肝癌患者中的臨床意義

 

2、膠原I-DDR1信號(hào)增強(qiáng)腫瘤干細(xì)胞特征

為驗(yàn)證體外DDR1對(duì)肝癌細(xì)胞干性的影響,作者進(jìn)行sphere-forming assays。結(jié)果發(fā)現(xiàn),與相應(yīng)培養(yǎng)的貼壁細(xì)胞(non-CSCs)相比,DDR1蛋白水平在HCC球(CSCs)中顯著上調(diào)(圖2A)。DDR1作為維持干細(xì)胞自我更新潛能的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子和膜蛋白,過(guò)表達(dá)DDR1促進(jìn)SOX2、NANOG和EPCAM的mRNA表達(dá)。I型膠原刺激進(jìn)一步放大了這種效應(yīng)。然而,過(guò)表達(dá)DDR1激酶死亡突變體(DDR1-K618A)和膠原結(jié)合缺陷突變體(DDR1-R105A)并沒(méi)有達(dá)到這種效果。TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中DDR1表達(dá)與CD133呈正相關(guān),組織芯片的IHC驗(yàn)證了這一點(diǎn)(圖2B-C)。此外,DDR1過(guò)表達(dá)或I型膠原刺激誘導(dǎo)球形成效率、CD133陽(yáng)性細(xì)胞數(shù)、單細(xì)胞克隆形成和對(duì)sorafenib或doxorubicin的耐藥性顯著增加。相反,過(guò)表達(dá)DDR1-K618A和DDR1-R105A突變體未能表現(xiàn)出相同的結(jié)果。相比之下,DDR1缺失顯著降低了這些CSC相關(guān)的生物學(xué)效應(yīng)(圖2D-G)。

在體內(nèi),作者使用異種移植模型來(lái)檢測(cè)DDR1在肝癌細(xì)胞中的作用。DDR1敲低成球細(xì)胞形成的皮下瘤明顯小于scramble細(xì)胞形成的皮下瘤(圖3A)。IHC結(jié)果顯示DDR1、Ki67和CD133的蛋白水平在亂序腫瘤中高于DDR1敲低腫瘤(圖3B)。為進(jìn)一步研究DDR1在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的作用,作者通過(guò)皮下注射N(xiāo)OD/SCID小鼠細(xì)胞,在NOD/SCID小鼠細(xì)胞中加入或不加入上調(diào)的DDR1細(xì)胞進(jìn)行有限稀釋實(shí)驗(yàn)。DDR1過(guò)表達(dá)顯著增強(qiáng)腫瘤形成能力,增加干細(xì)胞頻率(圖3C-E)。上述研究表明DDR1在體外和體內(nèi)促進(jìn)肝癌細(xì)胞干性和腫瘤發(fā)生,依賴(lài)于其激酶活性和膠原刺激。


圖2 DDR1在體外增強(qiáng)HCC細(xì)胞系的干性


圖3 DDR1在體內(nèi)增強(qiáng)HCC細(xì)胞系的干性

 

3、膠原誘導(dǎo)的DDR1激活是由CD44協(xié)同促進(jìn)的

為研究DDR1在肝細(xì)胞癌中的分子機(jī)制,作者使用IP/MS方法研究了其相互作用的伙伴。用FLAG-DDR1或FLAG-vector轉(zhuǎn)染SK-Hep1細(xì)胞,用抗FLAG抗體免疫沉淀。作者發(fā)現(xiàn)CD44(CSCs標(biāo)記物)是DDR1潛在的相互作用蛋白之一(圖4A)。免疫共沉淀(Co-IP)和谷胱甘肽S -轉(zhuǎn)移酶(GST) pull-down實(shí)驗(yàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明DDR1與CD44存在相互作用和結(jié)合(圖4B-C)。此外,免疫熒光和激光共聚焦檢測(cè)外源性DDR1和CD44在293T細(xì)胞中的空間共定位。在HLF細(xì)胞中觀察到類(lèi)似的內(nèi)源性DDR1和CD44表達(dá)(圖4D)。隨后,作者進(jìn)行了有/無(wú)I型膠原蛋白激活的co-IP實(shí)驗(yàn),發(fā)現(xiàn)膠原蛋白I增加DDR1與CD44的相互作用(圖4E)。由于CD44可以作為輔助受體介導(dǎo)受體內(nèi)化、激活、降解或調(diào)節(jié)受體激酶活性,作者推測(cè)CD44是否可以調(diào)節(jié)I型膠原誘導(dǎo)的DDR1活化。Co-IP實(shí)驗(yàn)表明,CD44敲低降低了DDR1的酪氨酸磷酸化(圖4F)。過(guò)表達(dá)CD44以時(shí)間依賴(lài)的方式促進(jìn)Ⅰ型膠原誘導(dǎo)的DDR1的磷酸化。在HLF細(xì)胞中敲低DDR1則減弱這種作用(圖4G)。結(jié)果提示CD44促進(jìn)Ⅰ型膠原誘導(dǎo)的肝癌細(xì)胞DDR1的活化。CD44在肝癌中的功能是否依賴(lài)于DDR1,作者在CD44過(guò)表達(dá)的HLF細(xì)胞中敲低DDR1,在CD44敲低的Hep3B細(xì)胞中過(guò)表達(dá)DDR1。DDR1敲除部分降低了肝癌細(xì)胞的成球率、單細(xì)胞克隆形成率、CD133陽(yáng)性的干細(xì)胞樣細(xì)胞比例以及CD44過(guò)表達(dá)導(dǎo)致的化療耐藥。DDR1的過(guò)表達(dá)部分增強(qiáng)了I型膠原內(nèi)CD44缺失所降低的CSCs特性(圖5A-D)。CD44過(guò)表達(dá)細(xì)胞形成的皮下腫瘤的體積和重量明顯大于空載體或CD44/shDDR1細(xì)胞形成的皮下腫瘤(圖5E)。以上證據(jù)表明DDR1是CD44介導(dǎo)的肝癌細(xì)胞干性信號(hào)所必需的關(guān)鍵蛋白。


 

圖4 CD44與DDR1相互作用,促進(jìn)DDR1磷酸化


圖5 體內(nèi)外CD44與DDR1的交互作用增強(qiáng)了HCC細(xì)胞系的干細(xì)胞性

 

4、DDR1通過(guò)促進(jìn)PP2AA募集到MST1/2而使Hippo信號(hào)失活

為確定DDR1影響HCC細(xì)胞干性的途徑,作者對(duì)DDR1敲低的HCC細(xì)胞和對(duì)照細(xì)胞進(jìn)行了RNA測(cè)序。KEGG通路分析發(fā)現(xiàn)DDR1缺失顯著改變了Hippo信號(hào)通路(圖6A)。基于TCGA數(shù)據(jù)庫(kù),DDR1與YAP、CTGF、BCL2、AXL呈正相關(guān)。Hippo信號(hào)與腫瘤干性密切相關(guān),作者檢測(cè)了DDR1對(duì)YAP/TAZ(Hippo通路核心蛋白)下游基因表達(dá)的影響。結(jié)果顯示,在Hep3B細(xì)胞中過(guò)表達(dá)DDR1后,CTGF、CYR61、BCL2和AXL的mRNA水平上調(diào)。膠原蛋白I的存在進(jìn)一步增強(qiáng)了這些作用。相反,DDR1敲低顯著降低CTGF、CYR61、BCL2和AXL的表達(dá)(圖6B)。雙熒光素酶報(bào)告實(shí)驗(yàn)提示DDR1增強(qiáng)了Ⅰ型膠原中YAP/TEAD反應(yīng)元件的活性(圖6C)。核質(zhì)分離和免疫熒光實(shí)驗(yàn)表明,DDR1過(guò)表達(dá)促進(jìn)YAP易位進(jìn)入細(xì)胞核(圖6D-E)。Western blotting顯示,I型膠原刺激的DDR1磷酸化降低了MST1磷酸化,增強(qiáng)了YAP的激活,而DDR1敲除則表現(xiàn)出相反的效果(圖6F)。這些結(jié)果表明膠原I-DDR1信號(hào)通路可誘導(dǎo)YAP活化。

protein phosphatase 2 scaffold subunit A alpha(PP2AA; PPP2R1A)作為經(jīng)典的上游磷酸酶,可以使MST1/2去磷酸化,從而使Hippo信號(hào)通路失活。作者分析了與DDR1相互作用的蛋白。PP2AA是DDR1潛在的相互作用蛋白(圖4A)。募集實(shí)驗(yàn)表明DDR1以膠原依賴(lài)的方式促進(jìn)PP2AA向MST1的募集(圖6G)。PP2AA缺失減弱了膠原IDDR1信號(hào)誘導(dǎo)的MST1和LAST1去磷酸化,導(dǎo)致YAP激活(圖6H)。這些結(jié)果表明,PP2AA是膠原I-DDR1信號(hào)誘導(dǎo)YAP活化所必需的。

在臨床樣本中,作者評(píng)估了39例HCC患者組織樣本中p-DDR1、CD44和YAP蛋白水平。結(jié)果顯示,肝癌組織中p-DDR1、CD44和YAP水平呈正相關(guān)(圖6I)。基于I型膠原的IHC染色,將樣本分為I型膠原陽(yáng)性(Ⅰ型膠原+)和I型膠原陰性(Ⅰ型膠原-)表達(dá)組。作者隨后進(jìn)行了多色免疫熒光(IF)來(lái)分析這三種蛋白的共定位(圖6J)。如上所述,在I型膠原沉積過(guò)程中,p-DDR1和CD44水平與YAP的表達(dá)密切相關(guān)。


圖6 DDR1通過(guò)滅活YAP阻礙Hippo信號(hào)傳導(dǎo)

 

5、聯(lián)合抑制DDR1和YAP在肝癌細(xì)胞干性中具有協(xié)同作用

為驗(yàn)證DDR1是否通過(guò)YAP發(fā)揮作用,作者使用DDR1抑制劑(7rh)和YAP抑制劑(verteporfin; VP)進(jìn)行體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)。7rh是一種ATP競(jìng)爭(zhēng)性口服DDR1特異性小分子抑制劑。Verteporfin(VP)是YAP/TAZ的抑制劑,在FDA批準(zhǔn)的小分子化合物庫(kù)中被鑒定,并被報(bào)道在空間上阻礙YAP和TEAD之間的相互作用。單獨(dú)使用7rh或VP處理分別減少了成球效率、克隆形成和CD133?+?細(xì)胞比例的細(xì)胞數(shù)量,并減少了移植瘤的體積和重量。與單藥相比,7rh和VP聯(lián)合處理進(jìn)一步減弱了這些效應(yīng)(圖7A-D)。IHC結(jié)果顯示,與7rh或VP處理的腫瘤相比,Ki67和CD133在scrambled腫瘤中染色更強(qiáng)烈。聯(lián)合組腫瘤中Ki67和CD133表達(dá)最低(圖7E),聯(lián)合治療顯示出良好的抗腫瘤治療效果。


 

圖7 DDR1和YAP信號(hào)共同抑制體外和體內(nèi)腫瘤增殖

 

6、臨床放射組學(xué)預(yù)測(cè)模型

在組織芯片的患者中,作者獲得了92張T2WI圖像,共有65例患者最終納入本次回顧性研究。預(yù)測(cè)模型依賴(lài)于Ⅰ型膠原IHC評(píng)分。將患者分為高、低兩組。采用受試者工作特征(ROC)曲線分析評(píng)估模型性能。結(jié)果顯示,基于14個(gè)特征的模型在驗(yàn)證數(shù)據(jù)集上獲得了最高的AUC(圖8A)。此時(shí),對(duì)于測(cè)試數(shù)據(jù)集,模型的AUC和預(yù)測(cè)精度分別為0.717和0.700。臨床診斷統(tǒng)計(jì)及所選特征見(jiàn)圖8B。


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圖8 預(yù)測(cè)膠原I表達(dá)的放射組學(xué)模型

 

結(jié)論

總之,本研究結(jié)果表明,CD44介導(dǎo)的膠原I-DDR1信號(hào)作為腫瘤激勵(lì)因子,通過(guò)募集PP2AA激活YAP來(lái)促進(jìn)HCC細(xì)胞的干細(xì)胞性。在HCC組織中,膠原I和DDR1表達(dá)的增加預(yù)示著預(yù)后不良,因此可以作為HCC有希望的生物標(biāo)志物和新的治療策略。

 

參考文獻(xiàn)

Xiong YX, Zhang XC, Zhu JH, Zhang YX, Pan YL, Wu Y, Zhao JP, Liu JJ, Lu YX, Liang HF, Zhang ZG, Zhang WG.(2023). Collagen I-DDR1 signaling promotes hepatocellular carcinoma cell stemness via Hippo signaling repression. Cell Death Differ. doi: 10.1038/s41418-023-01166-5.