scBrainMap：大腦中細(xì)胞類型和相關(guān)遺傳標(biāo)記的景觀

       腦細(xì)胞類型的多樣性是神經(jīng)元回路的基本組成部分。現(xiàn)代神經(jīng)科學(xué)的一個(gè)主要目標(biāo)是破譯各種類型的細(xì)胞組成并表征其特性。由于神經(jīng)元細(xì)胞的高度異質(zhì)性，直到最近，還不可能以高分辨率對(duì)腦細(xì)胞類型進(jìn)行分組。得益于單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)，scBrainMap建立了一個(gè)針對(duì)幾個(gè)物種的腦細(xì)胞類型和相關(guān)遺傳標(biāo)記的數(shù)據(jù)庫。該數(shù)據(jù)庫包含4881種細(xì)胞類型。scBrainMap使用戶能夠針對(duì)不同的感興趣細(xì)胞類型執(zhí)行定制的、交聯(lián)的、生物學(xué)相關(guān)的查詢。
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• Cell types

       用戶可以搜索目標(biāo)基因以找到其潛在信息，也可以選擇物種來篩選標(biāo)記并查看進(jìn)一步的信息，還可以使用不同類型的標(biāo)記基因選擇：

       點(diǎn)擊感興趣的物種及其細(xì)胞類型后將在頁面下方展示所有結(jié)果，接下來可以通過選擇特定的細(xì)胞/疾病等信息進(jìn)行結(jié)果篩選：

       繼續(xù)點(diǎn)擊某一特定細(xì)胞類型，將跳轉(zhuǎn)至該細(xì)胞的詳情頁，可以瀏覽該細(xì)胞的數(shù)據(jù)來源、top20的marker基因：

• Brain regions

       用戶可以選擇感興趣的物種來尋找不同大腦區(qū)域的遺傳標(biāo)記，也可以點(diǎn)擊不同的大腦區(qū)域來篩選它們的細(xì)胞類型：

       以“Human”為例，在圖中點(diǎn)擊感興趣的區(qū)域即可在下方顯示細(xì)胞類型信息：

• Conditions

       用戶也可以通過選擇發(fā)育階段或疾病類型來尋找遺傳標(biāo)記：

       以“Disease”為例，在左側(cè)欄選擇物種后，點(diǎn)擊感興趣的疾病類型，即可瀏覽下?lián)茴愋托畔ⅲ?br/>