BLAB2CancerKD：乳酸菌與癌癥數(shù)據(jù)庫

欄目：最新研究動態(tài) 發(fā)布時間：2023-08-30
該數(shù)據(jù)庫使用7794篇乳酸菌癌文獻作為源數(shù)據(jù)，處理了16543個生物醫(yī)學(xué)概念和23091個關(guān)聯(lián)......

       癌癥是一種某些細胞生長失控并擴散到身體其他部位的疾病，是全球人類死亡的主要原因之一。研究表明，乳酸菌（LAB）可以調(diào)節(jié)人體腸道菌群，提高胃腸功能和身體免疫力。近年來，LAB在癌癥治療中的潛力引起了人們的關(guān)注。
       該數(shù)據(jù)庫使用7794篇乳酸菌癌文獻作為源數(shù)據(jù)，處理了16543個生物醫(yī)學(xué)概念和23091個關(guān)聯(lián)。構(gòu)建了一個包含31434條結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)的本體。BLAB2CancerKD以各種數(shù)據(jù)呈現(xiàn)形式直觀、清晰地呈現(xiàn)了所有相關(guān)知識，交互系統(tǒng)功能也使其更加高效。
       http://110.40.139.2:18095/

  • BLAB2CancerKG module 1 (adjustable category display)

       該模塊主要以數(shù)據(jù)顯示為主。用戶可以搜索“concept”或“association”來獲得KG，然后單擊標簽圖例來隱藏或顯示不同類別。該模塊支持csv、.JSON和.PNG格式的圖片導(dǎo)出。

  • BLAB2CancerKG module 2 (adjustable search object)

       用戶通過搜索獲得結(jié)果圖后，可以通過點擊“switch layout”按鈕在兩種不同的KG顯示形式之間切換，并支持.CSV格式的數(shù)據(jù)下載。


       此外，可以點擊一個節(jié)點，以該節(jié)點為中心節(jié)點查看KG，并同時提供谷歌搜索和NCBI搜索。

  • BLAB2CancerKG module 4 (focus on cancer)

       該模塊只顯示與癌癥相關(guān)的乳酸菌信息，提供了占最大比例的八個腫瘤類別的子圖。

  • BLAB2CancerKG Ontology Data Sheet

       該模塊以列表形式顯示所有BLAB2Cancer本體結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)，提供搜索和數(shù)據(jù)導(dǎo)出功能，并提供PubMed鏈接用于可追溯性驗證。

  • Text annotation module

       本模塊包括所有與乳酸菌和癌癥相關(guān)的7794篇科學(xué)文獻摘要。用戶可以通過PMID或關(guān)鍵字搜索相應(yīng)的文獻摘要。該模塊突出顯示了所有相關(guān)的生物醫(yī)學(xué)概念，當光標放在相應(yīng)的實體概念上時，可以看到相應(yīng)的類別和NCBI_ID。