高度免疫抑制性腫瘤微環(huán)境(TME)和血腦屏障的存在是高級(jí)別膠質(zhì)瘤(HGG)患者誘導(dǎo)有效免疫應(yīng)答的兩大障礙。在本注冊(cè)臨床試驗(yàn)(NCT03392545)中,作者試圖通過顱內(nèi)注射poly(I:C)增強(qiáng)復(fù)發(fā)性HGG患者的局部固有免疫應(yīng)答,以建立強(qiáng)大的抗腫瘤免疫應(yīng)答。在隨訪過程中,12例(44.4%)患者達(dá)到腫瘤控制和生存獲益,被認(rèn)為是本研究的反應(yīng)者。作者發(fā)現(xiàn)poly(I:C)處理后,TME中的T細(xì)胞受體(TCR)譜發(fā)生了重塑。基于腫瘤樣本的RNA-seq分析,膜聯(lián)蛋白A1(ANXA1)在無反應(yīng)患者的腫瘤細(xì)胞中表達(dá)顯著上調(diào),并在蛋白水平進(jìn)一步驗(yàn)證。體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)表明,ANXA1通過其表面受體甲酰肽受體1(FPR1)誘導(dǎo)M2樣巨噬細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞產(chǎn)生,建立Treg細(xì)胞驅(qū)動(dòng)的免疫抑制性TME,并抑制poly(I:C)促進(jìn)的抗腫瘤免疫應(yīng)答。ANXA1/FPR1信號(hào)軸可通過促進(jìn)抗炎和Treg驅(qū)動(dòng)的TME抑制膠質(zhì)瘤患者的固有免疫反應(yīng)。ANXA1可作為poly(I:C)治療反應(yīng)的可靠預(yù)測(cè)因子,預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率達(dá)92.3%。鑒于這些顯著的發(fā)現(xiàn),本研究揭示了膠質(zhì)瘤免疫治療的新視角。本文于2023年12月發(fā)表于《Cellular & molecular immunology》,IF: 24.1;Q1。
技術(shù)路線:
主要實(shí)驗(yàn)結(jié)果:
1、HGG患者的治療和預(yù)后
本研究納入了一個(gè)包含27例患者的隊(duì)列。在術(shù)前和術(shù)后階段進(jìn)行了全面的采樣程序,以獲取腫瘤樣本、腦脊液(CSF)和外周血(圖1A)。從北京天壇醫(yī)院獲取患者的基因及臨床資料。
在27例患者中,1例(3.7%)達(dá)到完全緩解(CR),9例(33.3%)達(dá)到部分緩解(PR),2例(7.4%)達(dá)到疾病穩(wěn)定(SD),15例(55.6%)達(dá)到疾病進(jìn)展(PD),因此疾病控制率為44.4%(圖1B)。將達(dá)到CR、PR或SD的患者定義為有反應(yīng)者,而出現(xiàn)PD的患者定義為無反應(yīng)者。有反應(yīng)者的中位無進(jìn)展生存期和總生存期分別為221.0天和441.0天,顯著長(zhǎng)于無反應(yīng)者(P < 0.05)(圖1C和D)。
圖1 免疫佐劑poly(I:C)治療為應(yīng)答者提供了生存獲益
2、應(yīng)答者的CSF和TILs中存在CTLs的優(yōu)勢(shì)寡克隆
為了評(píng)估poly(I:C)治療后反應(yīng)組和無反應(yīng)組患者TME中細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞(CTLs)增殖的潛在差異,作者分析了兩組患者在poly(I:C)治療前后CSF、外周血淋巴細(xì)胞(PBLs)和腫瘤浸潤(rùn)淋巴細(xì)胞(TILs)的TCR譜模式。發(fā)現(xiàn)CSF中可能發(fā)生了一些優(yōu)勢(shì)克隆的擴(kuò)增,最終導(dǎo)致CSF中細(xì)胞數(shù)量增加,而不影響TCR克隆型。
進(jìn)一步分析各組間CSF和PBLs中所有克隆型TCRs的比例。CSF內(nèi)TCR多樣性的變化顯示出有應(yīng)答組和無應(yīng)答組之間的顯著差異,而這一趨勢(shì)在PBLs分析中消失(圖2A)。在應(yīng)答者的CSF中,占總克隆空間5%以上的超擴(kuò)增克隆型特異性富集(圖2B)。作者進(jìn)一步分析了前10個(gè)TCR克隆在應(yīng)答者和無應(yīng)答者之間的比例,發(fā)現(xiàn)擴(kuò)增最多的克隆型在應(yīng)答者CSF中占據(jù)了顯著更大的克隆空間百分比(圖2C)。正如預(yù)期的那樣,部分CTL克隆在CSF和TILs中強(qiáng)勁增殖發(fā)生于有應(yīng)答者,而非無應(yīng)答者(圖2D)。此外,在接受poly(I:C)治療后,高度豐富的克隆型僅在有應(yīng)答者的TILs中顯著富集,而在無應(yīng)答者的TILs中未顯著富集(圖2E),這表明局部腫瘤中的T細(xì)胞庫(kù)發(fā)生了重塑。
圖2 對(duì)poly(I:C)應(yīng)答組和無應(yīng)答組之間配對(duì)CSF和PBL樣本的TCR多樣性分析
3、無應(yīng)答者的TME以Treg細(xì)胞為主
由于應(yīng)答者表現(xiàn)出優(yōu)勢(shì)的CTL增殖,作者使用scRNA-seq和配對(duì)TCR-seq擴(kuò)展了TILs中CD45+免疫細(xì)胞的特征。作者最初通過無監(jiān)督聚類法在2個(gè)樣本中識(shí)別出10個(gè)不同的T細(xì)胞簇(圖3A)。CD8+和CD4+ T細(xì)胞表現(xiàn)為表達(dá)na?ve標(biāo)志物(SELL和CCR7)、活化效應(yīng)標(biāo)志物(GZMA、GZMH和GZMK)或耗竭標(biāo)志物(PDCD1和HAVCR2)的亞群。此外,Treg細(xì)胞表達(dá)CD4和FOXP3(圖3B)。接下來的聚類分析表明,無應(yīng)答者的TCR克隆主要是CD4+ Treg細(xì)胞和耗竭的CD4+細(xì)胞,而有應(yīng)答者的TCR克隆主要是記憶性和效應(yīng)性T細(xì)胞(圖3C)。作者進(jìn)一步將免疫細(xì)胞分為三個(gè)主要亞組(Treg細(xì)胞、非Treg CD4+細(xì)胞和CD8+細(xì)胞),發(fā)現(xiàn)Treg細(xì)胞在無應(yīng)答者的腫瘤中占優(yōu)勢(shì),而CD8+細(xì)胞在有應(yīng)答者的腫瘤中富集(圖3D)。有趣的是,根據(jù)治療前后樣本中TCR比率的變化,結(jié)合從緩解后復(fù)發(fā)腫瘤中獲得的scRNA-seq數(shù)據(jù),作者發(fā)現(xiàn),在無反應(yīng)者的治療后腫瘤中比例增加的克隆最終退化為耗竭和Treg CD4+細(xì)胞(圖3E)。而緩解組患者治療后腫瘤中高比例和遞減比例的克隆主要為CTLs,且多為復(fù)發(fā)后的效應(yīng)性、記憶性和耗竭性CD8+細(xì)胞(圖3F)。這些結(jié)果表明,無應(yīng)答患者增加的Treg細(xì)胞產(chǎn)生了免疫抑制性TME。
圖3 scRNA-seq分析揭示無應(yīng)答者保留了以Treg細(xì)胞為主的腫瘤微環(huán)境
4、無應(yīng)答者可促進(jìn)過度炎癥性TME
為進(jìn)一步研究產(chǎn)生這種不同治療應(yīng)答的原因,并確定對(duì)poly(I:C)產(chǎn)生應(yīng)答的預(yù)測(cè)因素,作者對(duì)應(yīng)答者和無應(yīng)答者的6個(gè)治療前樣本的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了測(cè)序。對(duì)差異表達(dá)基因的功能富集分析顯示,在無應(yīng)答者中,許多參與適應(yīng)性和固有免疫的免疫相關(guān)基因模塊上調(diào)(圖4A和B)。此外,無應(yīng)答者中大多數(shù)下調(diào)的模塊與神經(jīng)發(fā)育功能相關(guān)(圖4C和D)。
為了更好地了解無應(yīng)答患者的特征,作者系統(tǒng)分析了癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)中作為對(duì)照的5例癌旁正常組織(GBM)樣本、2例有應(yīng)答的復(fù)發(fā)患者樣本的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和既往測(cè)序數(shù)據(jù)。綜合分析表明,治療前應(yīng)答組樣本的基因表達(dá)模式與癌旁組樣本相似,而復(fù)發(fā)應(yīng)答組樣本的特征介于應(yīng)答組和無應(yīng)答組之間(圖4E-G)。這一發(fā)現(xiàn)提示了患者從免疫應(yīng)答到無應(yīng)答的轉(zhuǎn)錄特征逐漸轉(zhuǎn)化。值得注意的是,與其他患者的樣本相比,在無應(yīng)答者的樣本中,免疫相關(guān)模塊顯著上調(diào)(圖4F)。這些發(fā)現(xiàn)提示無反應(yīng)患者的TME與過度激活和過度炎癥相關(guān)。
圖4 應(yīng)答者和無應(yīng)答者之間轉(zhuǎn)錄組譜的差異
5、ANXA1是TLR3配體應(yīng)答的潛在預(yù)測(cè)因子
通過差異表達(dá)分析,作者確定了上調(diào)或下調(diào)的前20個(gè)差異表達(dá)基因(圖4H)。通過定量PCR驗(yàn)證,作者發(fā)現(xiàn)有應(yīng)答者和無應(yīng)答者之間的ANXA1水平顯著不同(圖5A)。因此,作者后續(xù)的分析集中在ANXA1上。通過比較ANXA1在4組(癌旁組、無應(yīng)答組、有應(yīng)答組和有應(yīng)答的復(fù)發(fā)組)中的表達(dá)水平,作者發(fā)現(xiàn)ANXA1在無應(yīng)答組中表達(dá)最高,其次是在正常組和有應(yīng)答組中表達(dá)較低(圖5B)。免疫組化數(shù)據(jù)還表明,ANXA1在無應(yīng)答者的腫瘤中高表達(dá),并且其表達(dá)在應(yīng)答組中非常低,但在復(fù)發(fā)組中升高(圖5C)。此外,作者根據(jù)TCGA和GTEx數(shù)據(jù)庫(kù)添加了數(shù)百個(gè)膠質(zhì)瘤腫瘤和對(duì)照正常組織之間的樣本中ANXA1的表達(dá)。分析結(jié)果顯示,ANXA1在膠質(zhì)瘤中的表達(dá)水平顯著高于正常組織。通過回顧性分析接受poly(I:C)治療的患者中ANXA1蛋白的表達(dá),探討ANXA1作為TLR3配體治療應(yīng)答預(yù)測(cè)因子的有效性。作者的結(jié)果表明,有應(yīng)答者的ANXA1表達(dá)顯著低于無應(yīng)答者。受試者工作特征(ROC)曲線顯示,ANXA1預(yù)測(cè)TLR3配體應(yīng)答的敏感度、特異度和準(zhǔn)確度分別為91.7%、92.9%和92.3%(圖5D)。
圖5 膠質(zhì)瘤源性ANXA1誘導(dǎo)M2樣巨噬細(xì)胞募集Treg細(xì)胞
6、ANXA1可誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2型極化
雖然ANXA1在細(xì)胞中廣泛表達(dá),但根據(jù)單細(xì)胞數(shù)據(jù),腫瘤細(xì)胞是應(yīng)答者和無應(yīng)答者之間不同表達(dá)模式的主要來源(圖5E)。FPR1作為ANXA1的主要受體,主要表達(dá)于無應(yīng)答的小膠質(zhì)細(xì)胞和巨噬細(xì)胞(圖5F)。這些結(jié)果提示腫瘤中巨噬細(xì)胞可能通過分泌一些趨化因子來招募Treg細(xì)胞。因此,作者通過單細(xì)胞RNA-seq測(cè)定了巨噬細(xì)胞中CCL22的表達(dá),發(fā)現(xiàn)應(yīng)答樣本中的CCL22表達(dá)顯著高于無應(yīng)答樣本(圖5G)。既往研究表明M2型巨噬細(xì)胞募集更多的Treg細(xì)胞,因此作者評(píng)估了M2型相關(guān)基因在巨噬細(xì)胞中的表達(dá)。根據(jù)M1(IL6、IL1B、IL12B、CD86、CXCL9、CXCL10、IFNB1、IFNAR1和TNF)和M2(IL10、CCL22、ARG1、MRC1、CD163、MRC1、TGFB1、IRF4、TGM2、CXCL12和CXCR4)標(biāo)記基因,作者對(duì)單細(xì)胞RNA-seq中的每個(gè)巨噬細(xì)胞進(jìn)行了評(píng)分,并證實(shí)無應(yīng)答(P1)樣本中的巨噬細(xì)胞顯示出更強(qiáng)的M2表型(圖5H)。
這一與腫瘤-巨噬細(xì)胞/小膠質(zhì)細(xì)胞-Treg關(guān)系相關(guān)的見解促使作者探索ANXA1在調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞極化中的作用。在U251細(xì)胞與巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)體系中,通過檢測(cè)巨噬細(xì)胞表面標(biāo)志物CD163和CD206的表達(dá)來評(píng)估其M2型表型。流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)結(jié)果顯示,與U251-ANXA1High膠質(zhì)瘤細(xì)胞共培養(yǎng)組的M2型巨噬細(xì)胞數(shù)量高于與U251-ANXA1Low膠質(zhì)瘤細(xì)胞共培養(yǎng)組。這些結(jié)果共同支持ANXA1在觸發(fā)巨噬細(xì)胞M2表型極化中發(fā)揮關(guān)鍵作用的結(jié)論(圖5I)。此外,與未處理的巨噬細(xì)胞相比,重組人類ANXA1處理的巨噬細(xì)胞釋放更高水平的CCL22,而poly(I:C)顯著抑制ANXA1的誘導(dǎo)并進(jìn)一步降低巨噬細(xì)胞中CCL22的表達(dá)。加入FPR1抑制劑HCH6-1可抑制ANXA1誘導(dǎo)的CCL22水平升高(圖5J)。
為了驗(yàn)證ANXA1/FPR1軸在腫瘤細(xì)胞和巨噬細(xì)胞之間募集Treg細(xì)胞的功能,作者進(jìn)行了Treg趨化實(shí)驗(yàn),結(jié)果表明ANXA1處理的M2巨噬細(xì)胞比未處理的M2巨噬細(xì)胞募集更多的Treg細(xì)胞(圖5K)。這些結(jié)果表明ANXA1可以顯著增強(qiáng)巨噬細(xì)胞募集Treg細(xì)胞的能力。
此外,poly(I:C)刺激后,M0細(xì)胞中TLR3的mRNA表達(dá)顯著激活,加入FPR1抑制劑HCH6-1后,激活效率無明顯影響,但ANXA1與poly(I:C)共存導(dǎo)致TLR3下調(diào)(圖5L)。這一結(jié)果表明ANXA1通過下調(diào)其受體TLR3的表達(dá)來抑制對(duì)poly(I:C)的應(yīng)答。
圖6 膠質(zhì)瘤中ANXA1的低表達(dá)與原位腫瘤小鼠對(duì)TLR3配體的有效反應(yīng)相關(guān)
7、降低ANXA1的表達(dá)可提高對(duì)TLR3配體的應(yīng)答
作者使用GL261細(xì)胞建立原位腫瘤小鼠模型,研究ANXA1對(duì)TLR3配體的直接影響。對(duì)小鼠進(jìn)行Poly(I:C)免疫治療。作者對(duì)腫瘤進(jìn)行了RNAseq分析,發(fā)現(xiàn)poly(I:C)應(yīng)答小鼠的ANXA1表達(dá)水平相對(duì)較低,這與正常小鼠腦組織中的ANXA1表達(dá)水平相似(圖6A)。為了確定該模型小鼠原位腫瘤中的腫瘤浸潤(rùn)T細(xì)胞類型,作者分析了來自小鼠樣本的細(xì)胞,發(fā)現(xiàn)與無應(yīng)答小鼠的腫瘤相比,CD8細(xì)胞在有應(yīng)答小鼠的腫瘤中顯著富集。相反,無應(yīng)答小鼠的Treg細(xì)胞水平高于有應(yīng)答小鼠(圖6B和C)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證ANXA1和TLR3配體之間的關(guān)聯(lián),作者使用GL261-ANXA1WT-luc和GL261-ANXA1KD-luc細(xì)胞在小鼠中產(chǎn)生原位腫瘤,并給予poly(I:C)(圖6D)。GL261-ANXA1WT-luc細(xì)胞較GL261-ANXA1KD-luc細(xì)胞誘導(dǎo)更多的實(shí)質(zhì)性腫瘤進(jìn)展。此外,腫瘤中ANXA1的低表達(dá)導(dǎo)致了對(duì)poly(I:C)的有效應(yīng)答,顯示了強(qiáng)大的腫瘤控制能力(圖6E和F)。此外,作者在所有實(shí)驗(yàn)小鼠中進(jìn)行了生存分析,結(jié)果顯示,接受poly(I:C)的ANXA1KD小鼠的生存時(shí)間顯著長(zhǎng)于未注射poly(I:C)的ANXA1WT小鼠(P < 0.01)(圖6G)。雖然這些小鼠在第20天被殺死,但四組小鼠的生存趨勢(shì)仍然可以為干預(yù)的效果提供有價(jià)值的見解。作者分析了小鼠原位腫瘤的TILs,發(fā)現(xiàn)在poly(I:C)處理后,GL261-ANXA1KD-luc小鼠比GL261-ANXA1WT-luc小鼠激活了更多的CD8細(xì)胞。相反,在GL261-ANXA1WT-luc小鼠的腫瘤中,Treg細(xì)胞和M2巨噬細(xì)胞的水平高于GL261-ANXA1KD-luc小鼠的腫瘤(圖6H)。流式細(xì)胞術(shù)數(shù)據(jù)與多色IF染色結(jié)果一致(圖6I)。因此,作者的數(shù)據(jù)表明,ANXA1水平較低的腫瘤對(duì)TLR3配體有更有效的應(yīng)答。
結(jié)論:
在本研究中,作者證明了膠質(zhì)瘤來源的ANXA1對(duì)體內(nèi)TLR3配體應(yīng)答有重要影響,通過ANXA1/FPR1軸使巨噬細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞向M2樣表型傾斜,促進(jìn)免疫抑制性TME的發(fā)展。作者的發(fā)現(xiàn)為ANXA1在膠質(zhì)瘤生物學(xué)中的功能提供了更多的機(jī)制見解。首先,作者發(fā)現(xiàn),如在對(duì)poly(I:C)有應(yīng)答的患者中觀察到的那樣,無應(yīng)答者在CSF或TILs中均不具有優(yōu)勢(shì)寡克隆的特征。其次,作者發(fā)現(xiàn)在無反應(yīng)的TME中,高炎癥和免疫抑制的TME伴隨著ANXA1的高表達(dá)被促進(jìn)。第三,作者發(fā)現(xiàn)ANXA1高表達(dá)可以觸發(fā)巨噬細(xì)胞向M2表型極化,增強(qiáng)Treg細(xì)胞浸潤(rùn),降低患者和膠質(zhì)瘤模型小鼠的生存率。作者的結(jié)果揭示了膠質(zhì)瘤細(xì)胞通過ANXA1/FPR1軸調(diào)節(jié)腦腫瘤環(huán)境的機(jī)制,并有助于TLR3配體的治療抵抗。
綜上所述,作者提出了以下模型(圖7):在無應(yīng)答膠質(zhì)瘤中,ANXA1的高表達(dá)與巨噬細(xì)胞和小膠質(zhì)細(xì)胞中FPR1的高表達(dá)相關(guān),后者可以通過趨化釋放抗炎細(xì)胞因子來招募Treg細(xì)胞;因此,以Treg細(xì)胞為主的免疫細(xì)胞群建立了免疫抑制性TME。與此模型一致,TME抑制了poly(I:C)的免疫激活,臨床表現(xiàn)為對(duì)poly(I:C)的抵抗。ANXA1被認(rèn)為是一個(gè)可靠的預(yù)測(cè)對(duì)TLR3配體反應(yīng)的指標(biāo),因?yàn)樗谀[瘤組織樣本中有應(yīng)答和無應(yīng)答之間的差異表達(dá)。從臨床角度來看,評(píng)估TLR3配體(如poly(I:C))的治療效用可能是有趣的,同時(shí)重點(diǎn)關(guān)注通過穿刺活檢確定的膠質(zhì)瘤腫瘤組織中ANXA1表達(dá)水平與癌旁組織相似或略低的患者人群。這種方法有助于制定個(gè)性化的免疫治療方案。對(duì)于無應(yīng)答者,FPR1阻滯劑可能克服poly(I:C)耐藥,但仍需要臨床試驗(yàn)的支持。探索和了解ANXA1在膠質(zhì)瘤生物學(xué)中的分子機(jī)制,可拓寬TLR3配體應(yīng)答者的靶人群,改善膠質(zhì)瘤患者的預(yù)后。
圖7 在膠質(zhì)瘤的TME中,ANXA1/FPR1軸和TLR3配體觸發(fā)了抗腫瘤免疫應(yīng)答
實(shí)驗(yàn)方法:
制備單細(xì)胞懸浮液;CD8+CTLs TCR庫(kù)的建立與分析;單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seq)和scRNA-seq數(shù)據(jù)處理;TCR測(cè)序(TCR-seq)數(shù)據(jù)處理;細(xì)胞間相互作用;RNA-seq數(shù)據(jù)分析及富集分析;組織切片和免疫組化(IHC);免疫熒光(IF);細(xì)胞系和培養(yǎng)條件;流式細(xì)胞術(shù);趨化性實(shí)驗(yàn);小鼠模型。
參考文獻(xiàn):
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